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liuqingrui5金虫 (小有名气)
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NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢
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| NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢？ |
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2楼2013-07-18 09:03:19
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gyesang
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| 最好贴出链接，举例说明，如果是NP_这种参考序列，他给出的分子量就纯粹是氨基酸序列计算出来的推测分子量，你知道，有时候蛋白分子存在各种修饰，实际分子量多大要靠具体实验来测定 |
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liuqingrui5
4楼2013-07-18 13:58:33
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liuqingrui5
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你这个得去查原始文献，我看了一下，这个纯化蛋白的分子量是54kD，这也是单体的分子量，然后他们就拿这个去做实验降解多聚赖氨酸，说明即使这个酶是个多亚基酶的话，也不存在其他的亚基，应该是同聚体 然后有报道，从其他菌株分离出来的PLD酶是同二聚体 具体的该行使功能的全酶复合体是几聚体，不得而知 附上该酶uniprot的链接：http://www.uniprot.org/uniprot/Q2WFD9[ Last edited by gyesang on 2013-7-19 at 12:55 ] |
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2013-07-19 12:55:40, 235.09 K
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7楼2013-07-19 12:54:08
liuqingrui5
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8楼2013-07-20 10:59:24
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你可以通过交联的方法来测定是几聚体，给你个参考文献： Cross-linking To cross-link free amino groups of Myc-tagged CUTA protein, the HeLa-CUTA cells were lysed in the lysis buffer (5 mM EDTA, 0.2% Triton-x-100, 58 mM Na2HPO4, 17 mM NaH2PO4, 68 mM NaCl). Then 100 ll of cell lysate was incubated with disuccinimidyl glutarate (DSG) (Pierce) of different concentration for 1 h on ice. The reaction was quenched with 10 mM Tris (pH 7.4) and the protein samples diluted in 5· loading buffer (Tris–HCl (pH 6.8), 0.25% bromophenol blue, 2% SDS, 10% glycerol, 0.1 M DTT) were run on a 12% SDS-polyacrylamide gel for Western blot analysis.  出处：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17924204 |
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9楼2013-07-20 11:26:10
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