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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

[求助] NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢

NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢?
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gyesang

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-07-21 08:01:25
引用回帖:
8楼: Originally posted by liuqingrui5 at 2013-07-20 10:59:24
文献里是纯化出来的酶跑SDS-PAGE,测得亚基分子量时54kD,但是并没有测出全酶的分子量。我现在也纯化出了这个酶,经MADI-TOF/TOF MS鉴定与该文献中酶匹配,SDS-PAGE测得亚基分子量约为54kD,我想通过测定全酶分子量 ...

你可以通过交联的方法来测定是几聚体,给你个参考文献:
Cross-linking
To cross-link free amino groups of Myc-tagged CUTA protein, the HeLa-CUTA cells were lysed in the lysis buffer (5 mM EDTA, 0.2% Triton-x-100, 58 mM Na2HPO4, 17 mM NaH2PO4, 68 mM NaCl). Then 100 ll of cell lysate was incubated with disuccinimidyl glutarate (DSG) (Pierce) of different concentration for 1 h on ice.
The reaction was quenched with 10 mM Tris (pH 7.4) and the protein samples diluted in 5· loading buffer (Tris–HCl (pH 6.8), 0.25% bromophenol blue, 2% SDS, 10% glycerol, 0.1 M DTT) were run on a 12% SDS-polyacrylamide gel for Western blot analysis.

NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢

出处:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17924204

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9楼2013-07-20 11:26:10
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huanghznd

金虫 (小有名气)

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gyesang: 金币+2, 正解!鼓励交流! 2013-07-18 13:56:41
数据库中给出的蛋白分子量就是对应的蛋白氨基酸序列的分子量,如果序列是一个蛋白的亚基,那就是亚基的分子量。
2楼2013-07-18 09:03:19
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hyphen007

金虫 (小有名气)

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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 08:00:53
应该是看蛋白是单体还是复合体吧,貌似,若是单体,就是一条多肽链,不过应该是亚基的吧
3楼2013-07-18 13:00:12
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gyesang

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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-07-21 08:01:04
最好贴出链接,举例说明,如果是NP_这种参考序列,他给出的分子量就纯粹是氨基酸序列计算出来的推测分子量,你知道,有时候蛋白分子存在各种修饰,实际分子量多大要靠具体实验来测定

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4楼2013-07-18 13:58:33
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