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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢
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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

[求助] NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢

NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢？
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1楼 2013-07-18 08:23:01
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liuqingrui5

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by gyesang at 2013-07-19 12:54:08
你这个得去查原始文献，我看了一下，这个纯化蛋白的分子量是54kD，这也是单体的分子量，然后他们就拿这个去做实验降解多聚赖氨酸，说明即使这个酶是个多亚基酶的话，也不存在其他的亚基，应该是同聚体

然后 ...

文献里是纯化出来的酶跑SDS-PAGE，测得亚基分子量时54kD，但是并没有测出全酶的分子量。我现在也纯化出了这个酶，经MADI-TOF/TOF MS鉴定与该文献中酶匹配，SDS-PAGE测得亚基分子量约为54kD，我想通过测定全酶分子量判断其是几聚体，但是该酶是膜蛋白，水溶性不好，通过质谱无法测定分子量，GPC误差又很大。我现在是跑的该酶的SDS-PAGE还原与非还原电泳，条带位置一样，这样能否说明它是单体酶呢？
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8楼2013-07-20 10:59:24
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 正解！鼓励交流！ 2013-07-18 13:56:41
数据库中给出的蛋白分子量就是对应的蛋白氨基酸序列的分子量，如果序列是一个蛋白的亚基，那就是亚基的分子量。
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2楼2013-07-18 09:03:19
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hyphen007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 08:00:53
应该是看蛋白是单体还是复合体吧，貌似，若是单体，就是一条多肽链，不过应该是亚基的吧
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3楼2013-07-18 13:00:12
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-07-21 08:01:04
最好贴出链接，举例说明，如果是NP_这种参考序列，他给出的分子量就纯粹是氨基酸序列计算出来的推测分子量，你知道，有时候蛋白分子存在各种修饰，实际分子量多大要靠具体实验来测定
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liuqingrui5
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2013-07-18 13:58:33
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