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liuqingrui5

金虫 (小有名气)

[求助] NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢

NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢?
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gyesang

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-07-21 08:01:15
引用回帖:
6楼: Originally posted by liuqingrui5 at 2013-07-19 07:59:27
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/BAE53412.2就是这个酶  不知道它有几个亚基  全蛋白分子量是多少  非常感谢...

你这个得去查原始文献,我看了一下,这个纯化蛋白的分子量是54kD,这也是单体的分子量,然后他们就拿这个去做实验降解多聚赖氨酸,说明即使这个酶是个多亚基酶的话,也不存在其他的亚基,应该是同聚体

然后有报道,从其他菌株分离出来的PLD酶是同二聚体

具体的该行使功能的全酶复合体是几聚体,不得而知

附上该酶uniprot的链接:http://www.uniprot.org/uniprot/Q2WFD9[ Last edited by gyesang on 2013-7-19 at 12:55 ]

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  • 2013-07-19 12:55:40, 235.09 K

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7楼2013-07-19 12:54:08
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huanghznd

金虫 (小有名气)

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★ ★
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gyesang: 金币+2, 正解!鼓励交流! 2013-07-18 13:56:41
数据库中给出的蛋白分子量就是对应的蛋白氨基酸序列的分子量,如果序列是一个蛋白的亚基,那就是亚基的分子量。
2楼2013-07-18 09:03:19
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hyphen007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 08:00:53
应该是看蛋白是单体还是复合体吧,貌似,若是单体,就是一条多肽链,不过应该是亚基的吧
3楼2013-07-18 13:00:12
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-07-21 08:01:04
最好贴出链接,举例说明,如果是NP_这种参考序列,他给出的分子量就纯粹是氨基酸序列计算出来的推测分子量,你知道,有时候蛋白分子存在各种修饰,实际分子量多大要靠具体实验来测定

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4楼2013-07-18 13:58:33
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