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额纪

木虫 (初入文坛)

[求助] 构建质粒的问题

最近在构建一个质粒,化之后总是长不出菌来。很是苦恼
具体过程是:载体是一个Amp+的质粒,目的片段则含有kan+的抗性。目的片段用Taq plus酶P的,质粒经XcmI酶切后,和PCR片段一起跑电泳,然后割胶回收,回收的时候先PCR产物过柱,再酶切产物过柱,洗脱下来的产物取 再加入T4连接酶,4度过夜,第二天做转化。

之前转化都不长,昨天试了一下用单纯的质粒转化同一批次的感受态细胞,能长出一大片菌来,所以可以排除感受态和转化时操作有误的问题。问题应该出在连接上,求助各位,接下来应该怎么办?

酶切体系:dd水 27u   质粒8u    buffer   4u   XcmI酶  1u   用的是NEB的   37度 水浴2小时

跑胶的时候   20u PCR产物+4u 溴酚蓝     20u酶切产物+ 4u溴酚蓝(2个孔,共40u酶切产物)

连接体系:35u洗脱下来的回收产物,4u  buffer   1u T4连接酶

[ 来自小组 生物医药家族 ]
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-17 17:34:27
可以肯定的是,酶切后的质粒跟基因片段没有连接上。不知你的连接体系怎么样,但建议你基因片段:质粒=8:1,然后你之前4度连不好,可以改为酶连16度,时间4-6h。
2楼2013-07-17 17:22:04
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额纪

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-17 17:22:04
可以肯定的是,酶切后的质粒跟基因片段没有连接上。不知你的连接体系怎么样,但建议你基因片段:质粒=8:1,然后你之前4度连不好,可以改为酶连16度,时间4-6h。

4度过夜之后,放在16度里2h,再做转化的,是不是短了点?这个8:1是体积比吗?怎么控制要?
活在当下,做好自己
3楼2013-07-17 17:32:15
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

8:1是mol比,16度2h比较短
4楼2013-07-17 17:35:20
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额纪

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-17 17:35:20
8:1是mol比,16度2h比较短

摩尔比要怎么算啊……能指导一下吗?谢谢
活在当下,做好自己
5楼2013-07-17 18:23:08
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

先测一下浓度mg/ml,然后再按分子量大概算一下
6楼2013-07-17 18:25:18
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