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舟之帆

木虫 (小有名气)

[求助] PCR结果分析

各位大侠求救啊:
   我最近一直在做PCR,前天提的CDNA(总RNA纯度为1.4多),昨天PCR,结果跑出了单一条带(即我的目的基因),可是今天又提了CDNA(总RNA纯度为1.5多),步骤方法都一样,今天顺便PCR,结果发现P出了好多杂带,这是为什么啊?
   PCR结果有好多杂带,如果按这个条件可以做实时荧光定量PCR不?
   小女子不胜感激-------
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
舟之帆: 金币+5 2013-07-04 21:51:31
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-04 22:20:39
好多杂带是不能做荧光定量的。。另外,,rna纯度是什么概念?浓度吗?浓度高不一定质量也高,RNA要看浓度,看260/280的值,要在2.0左右。还要跑胶看条带,有无降解。。祝好、、可以交流

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2楼2013-07-04 21:45:37
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舟之帆

木虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 武穆大成 at 2013-07-04 21:45:37
好多杂带是不能做荧光定量的。。另外,,rna纯度是什么概念?浓度吗?浓度高不一定质量也高,RNA要看浓度,看260/280的值,要在2.0左右。还要跑胶看条带,有无降解。。祝好、、可以交流

RNA浓度有0.4ug/ul,260/280大概1.6。
3楼2013-07-04 21:51:17
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 舟之帆 at 2013-07-04 21:51:17
RNA浓度有0.4ug/ul,260/280大概1.6。...

哥们,1.6。。。。你跑个胶看下吧。我觉得这RNA的质量不太好。。
4楼2013-07-04 21:53:23
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gyesang

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【答案】应助回帖


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舟之帆: 金币+1, 有帮助, 细胞 2013-07-08 14:04:34
你是从什么材料里面提取的RNA,260/280 1.4或者1.5确实低了点,不知道你是否有跑DNA胶看下你的RNA的完整度
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-07-04 22:22:30
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舟之帆

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 武穆大成 at 2013-07-04 21:45:37
好多杂带是不能做荧光定量的。。另外,,rna纯度是什么概念?浓度吗?浓度高不一定质量也高,RNA要看浓度,看260/280的值,要在2.0左右。还要跑胶看条带,有无降解。。祝好、、可以交流

我改了一下退火温度,结果是比较好的,可是还是有点拖尾,想问问是怎么回事,怎么办?辛苦了!
6楼2013-07-08 14:15:58
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舟之帆

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 武穆大成 at 2013-07-04 21:45:37
好多杂带是不能做荧光定量的。。另外,,rna纯度是什么概念?浓度吗?浓度高不一定质量也高,RNA要看浓度,看260/280的值,要在2.0左右。还要跑胶看条带,有无降解。。祝好、、可以交流

我改了一下退火温度,结果是好点了,可是还是有点拖尾,怎么回事,怎么办?辛苦了,麻烦了....

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  • 附件 1 : 7月6日跟8日的实验结果.doc
  • 2013-07-08 14:20:16, 497 K
7楼2013-07-08 14:20:47
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

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gyesang: 金币+2, 感谢应助! 2013-07-08 15:21:35
舟之帆: 金币+2 2013-07-19 21:34:13
舟之帆: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-09-04 19:13:25
引用回帖:
7楼: Originally posted by 舟之帆 at 2013-07-08 14:20:47
我改了一下退火温度,结果是好点了,可是还是有点拖尾,怎么回事,怎么办?辛苦了,麻烦了.......

这位童鞋。。我猜,你给我看的应该是反转录后pcr的结果,我个人觉着这个结果还是挺好的。但还是有点拖尾。。拖尾的原因有可能是因为模板浓度有点大,可以做个梯度稀释下再跑pcr看看。。还有就是有可能是非特异扩增,这个是不是得做个荧光定量看下。看下溶解曲线怎么样,。。祝好
8楼2013-07-08 15:06:23
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