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lxyyzz

木虫 (小有名气)

[求助] 求助分子克隆问题——挑不出阳性克隆! 已有1人参与

分子克隆两个酶切位点是AgeI和XhoI,酶切6h后回收。
载体跑胶,看到的切割条带和预想的一样,8000bp和2000bp,选取8000bp的条带切胶回收。载体和片段回收后也跑过胶,大小位置都是对的。做了好几次都没有阳性克隆,长出的克隆都没有插入片段。

后来我只取了回收后的载体,同样加入连接酶连接转化后,发现板上也长了克隆!大概十几个左右的样子。我很不理解,按照道理说回收后的载体是线性的,并带有两个不同的粘性末端,应该不会再成环啊,为什么还能长的出克隆呢?

请高人帮忙解释下,给点建议!我是真不知道这种情况该怎么办了。
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木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-07-10 16:40:06
lxyyzz: 金币+8, 有帮助, 谢谢!载体酶切能清楚看到有两条带,和预期一样,两个酶应该都发挥作用了。其他几点我再去改进改进~ 2013-07-10 22:57:12
如果插入片段是PCR得到的,而不是从载体切割的,很大可能是酶切效果不好,有可能是因为保护碱基不够长,也可能是因为酶切体系活性不够强。
另外,载体双酶切也去磷酸化更保险,除非载体单酶切跟双酶切得到的载体片段有明显差别,否则不能排除只切开一个位点,那样胶回收再连接就很可能自身环化了。
还有就是感受态细胞的问题。
为什么
8楼2013-07-10 16:15:22
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

把PCR产物先进行T-A克隆或平末端克隆到克隆载体,再从克隆载体切下来,就保证末端是酶切好的粘性末端了。载体电泳时间延长点,如果可能,在另外的泳道加单酶切的载体做对照。
为什么
11楼2013-07-11 07:54:43
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