24小时热门版块排行榜    

查看: 3730  |  回复: 10
本帖产生 1 个 MicEPI ,点击这里进行查看

crazymouse66

金虫 (正式写手)

[求助] 绝对定量荧光PCR中做标准曲线的DNA的获得。

虫友们好,最近我想用16SRNA做一下土壤总DNA的 绝对定量荧光PCR,在这之前要做一条标准曲线,我就想问一下,做标准曲线时的已知浓度的DNA是怎么获得的?而且我接下来做的是从土壤中提取的中DNA的16sRNA的荧光定量PCR,因此我做标准曲线的一直浓度的DNA有什么要求吗?请大家帮帮忙。或者给我相应的参考文献也可以,谢谢大家。
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wubingqi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
crazymouse66: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 真的非常感谢,我以前都没做过这个,所以对此很不熟悉,谢谢你的帮助,让我大概有了一些了解,我先自己再查阅一些文献,有不懂的再请教您,谢谢啊。 2013-05-07 11:20:07
zhang8826857: 金币+5, MicEPI+1, good 2013-05-10 16:27:48
zhang8826857: 有兴趣来做本版的专家吗? 2013-05-10 16:28:12
这个最好是用带有目的片段的质粒作标准曲线,因为质粒相对稳定,不易降解。你首先要选择一个16s rDNA序列测定完毕的纯菌,你可以从的环境样品中随便分离一个细菌,用高保真酶扩增16s rDNA保守区域(比如V3区),然后通过连接载体转化后测序,然后你就知道这个片段(V3)的精确大小了。然后,重新用扩增那个细菌的这个片段(V3),pcr产物连接合适的载体(单克隆质粒,并只有一个克隆位点的),连接成功后转化,摇菌培养,然后从摇好的菌液中再提取这个带有目的片段质粒。下一步就是测定质粒的浓度和纯度了,测OD值即可,一般来说260nm吸光度下,1OD≈50mg/mL双链DNA,这样你就知道了你提取的带有目的片段的质粒的浓度了。因为载体的大小和目的片段(那个V3区)大小都已知,然后通过公式即可算出质粒的拷贝数,这个质粒的拷贝数和目的片段的拷贝数是一样的。最后,将这个质粒进行5倍或是10倍的梯度稀释,用这一系列的质粒上机荧光定量PCR做标准曲线就行了。
早上比较忙,介绍的有点混乱,不好意思
2楼2013-05-07 09:10:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

crazymouse66

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wubingqi at 2013-05-07 09:10:44
这个最好是用带有目的片段的质粒作标准曲线,因为质粒相对稳定,不易降解。你首先要选择一个16s rDNA序列测定完毕的纯菌,你可以从的环境样品中随便分离一个细菌,用高保真酶扩增16s rDNA保守区域(比如V3区),然后 ...

您好,请问您有相应的参考文献吗?我想看一下相应的参考文献,请提供一下参考文献的名字就可以了,谢谢啊。
3楼2013-05-10 09:03:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wubingqi

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by crazymouse66 at 2013-05-10 09:03:55
您好,请问您有相应的参考文献吗?我想看一下相应的参考文献,请提供一下参考文献的名字就可以了,谢谢啊。...

你看下《土壤中粉红粘帚霉67_1荧光定量PCR监测体系的建立及应用》这个论文吧,时间久了,只记得这么一个了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-05-10 09:22:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

crazymouse66

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by wubingqi at 2013-05-10 09:22:12
你看下《土壤中粉红粘帚霉67_1荧光定量PCR监测体系的建立及应用》这个论文吧,时间久了,只记得这么一个了。...

真的十分感谢
5楼2013-05-10 11:14:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feipiaolw

新虫 (初入文坛)

质粒DNA的扩增效率和线性的基因组可能不一致,因为质粒会形成超螺旋,影响引物和模板结合,所以最好是质粒酶切为线性后作为标曲的DNA模板。
学术一点,挺好的,要坚持
6楼2013-09-18 15:48:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huala2013

银虫 (著名写手)

你好!
请问下做标准曲线时,是每个样品都做,还是只要做一个样品就可以呢?
7楼2014-02-21 09:19:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

丹66

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
您好,我最近也在做土壤微生物QPCR,但是困在了标曲这块,想请问您一些关于制作标曲的问题!我理解的制作标曲的步骤是:提取土壤基因组;引物扩增;扩增片段与载体连接转入感受态中;从中筛选几个阳性克隆去测序。我想请教的是,这个方法对不?另外为什么要筛选几个阳性克隆?希望您能指导一下,另外希望您给帮忙推荐几篇详细介绍的文章,嘿嘿……

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2014-11-29 19:54:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lm8023

金虫 (小有名气)

送红花一朵
我想要下载地址
9楼2018-06-11 15:18:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Love蕾醒

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by 丹66 at 2014-11-29 19:54:55
您好,我最近也在做土壤微生物QPCR,但是困在了标曲这块,想请问您一些关于制作标曲的问题!我理解的制作标曲的步骤是:提取土壤基因组;引物扩增;扩增片段与载体连接转入感受态中;从中筛选几个阳性克隆去测序。我 ...

请问您这些问题解决了吗?我也有不懂这些问题,想知道答案。
10楼2019-11-05 16:46:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 crazymouse66 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +4 世界首富 2026-03-11 4/200 2026-03-17 09:23 by 雾散后相遇lc
[考研] 290求调剂 +5 @将就将就看 2026-03-10 9/450 2026-03-17 09:04 by 雾散后相遇lc
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:35 by 沐霖12138
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +8 秋有木北 2026-03-14 8/400 2026-03-16 15:21 by 哦哦123
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 326求调剂 +4 上岸的小葡 2026-03-15 5/250 2026-03-16 08:39 by Linda Hu
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 材料工程专硕,一志愿中国矿业大学,总分314,求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
请填处理意见