| 查看: 1495 | 回复: 7 | |||
[求助]
26s rDNA系统发育树的构建
|
| 我这方面是个菜鸟，完全不懂，身边的人做的是细菌的16s rDNA的发育树，我做的是真菌的26s rDNA D1/D2区的鉴定，这两种之间有什么不同的地方，可以照着16s的做么，有什么参数是要改的么？我在第一步搜索序列上就卡住了，先是在BLAST的Basic BLAST中选择nucleotide blast后，在选择Database时不知道该选择哪一个了，16S有专门的16s，那我该选择哪一个呢？？我和16S有什么地方 不同，哪里需要改动呢，劳大家帮忙了！ |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂
已经有10人回复
-
一志愿吉林大学材料学硕321求调剂
已经有8人回复
-
一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂
已经有6人回复
-
一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂
已经有3人回复
-
332求调剂
已经有3人回复
-
294求调剂材料与化工专硕
已经有7人回复
-
281求调剂（0805）
已经有17人回复
-
267一志愿南京工业大学0817化工求调剂
已经有10人回复
-
0817调剂
已经有3人回复
-
焦虑
已经有13人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 霉菌18SrDNA鉴定，构建发育树的问题
已经有6人回复
- 系统发育树构建
已经有31人回复
- 细菌种属的鉴定（系统发育树）--急用
已经有13人回复
- 在做系统发育树的时候，如何从genbank上选择下载同源序列呢
已经有10人回复
- 系统发育树bootsrap
已经有8人回复
- 关于构建系统发育树的问题，小白求教？为什么变形菌门老是不在一个分支
已经有10人回复
- 真菌18S rDNA 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊
已经有3人回复
- 系统发育树如何分析，得出结论？
已经有13人回复
- 基于氨基酸的系统发育树的构建
已经有6人回复
- 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊？送金币
已经有34人回复
- MEGA 5.0构建系统发育树的问题
已经有10人回复
- 关于生物进化发育树之类的分析
已经有9人回复
- 关于怎样建立基因文库，并通过文库建系统发育树
已经有9人回复
- 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
已经有7人回复
- 真菌种属鉴定 系统发育树构建
已经有5人回复
- 【求助/交流】（求助）急 回答就送金币啊关于mega 和phylip 画出来的系统发育树
已经有5人回复
- 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！
已经有6人回复
- 【求助/交流】如何构建系统更发育树
已经有16人回复
- 【求助/交流】MEGA 画系统发育树中的bootstrap values和Identity scores有什么区别？
已经有22人回复
- 请教：系统发育树怎么做？
已经有14人回复
2楼2013-04-10 20:41:40
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+3, 谢谢分享经验 2013-04-12 07:17:26
yanbi1: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 非常感谢你的帮助 other的下面也有很多数据库的选项 选择哪个呢？？ 2013-04-12 19:54:56
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+3, 谢谢分享经验 2013-04-12 07:17:26
yanbi1: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 非常感谢你的帮助 other的下面也有很多数据库的选项 选择哪个呢？？ 2013-04-12 19:54:56
|
Database里面选择other。 细菌和真菌在比对的时候是一样的。所有选项都一样，只是序列一个是细菌的一个是真菌的。最后比对出来都是你的序列对位相似的序列。 细菌16S和真菌26S都是细菌和真菌特有的基因序列。研究细菌的话针对16S来研究。真菌26S，当然也可以是18S或ITS。 |
3楼2013-04-11 09:15:34
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
yanbi14楼2013-04-12 07:20:37
5楼2013-04-12 19:56:15
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
6楼2013-04-13 08:11:40
7楼2013-04-13 19:59:15
8楼2014-06-22 10:34:32
50