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yanbi1

铜虫 (初入文坛)

[求助] 26s rDNA系统发育树的构建

我这方面是个菜鸟,完全不懂,身边的人做的是细菌的16s rDNA的发育树,我做的是真菌的26s rDNA D1/D2区的鉴定,这两种之间有什么不同的地方,可以照着16s的做么,有什么参数是要改的么?我在第一步搜索序列上就卡住了,先是在BLAST的Basic BLAST中选择nucleotide blast后,在选择Database时不知道该选择哪一个了,16S有专门的16s,那我该选择哪一个呢??我和16S有什么地方 不同,哪里需要改动呢,劳大家帮忙了!
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
yanbi1: 金币+20, ★★★很有帮助, 非常感谢! 2013-04-13 19:59:58
我会选择nucleotide collection (nr/nt)这个应该是最全的。

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4楼2013-04-12 07:20:37
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by yanbi1 at 2013-04-12 19:56:15
非常感谢你的帮助!想着也送给你20分的,结果我的等级不够呢,非常感谢!!...

这个不是因为等级,因为你本贴只悬赏了20个金币,那你只能奖励别人一共20个,除非你增加悬赏额度。不过无所谓了,能觉得有帮助就行
6楼2013-04-13 08:11:40
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