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fyjuan11

金虫 (正式写手)

[求助] 微生物鉴定之后怎么样建立系统发育树

鉴定了三株曲霉之后,想要建立系统发育树,我查了资料,mega也会用了,但是关键是怎么样下载相同或相似的基因序列,下载什么样的基因序列,学化工的,不会这个呀,希望有经验的虫子帮个忙,非常感谢。。。
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andyleier

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fyjuan11 at 2013-03-15 21:04:40
一般找几个就可以了呢?...

找四五十个,地域性的、同源性高90%-100%不同属的或者同一属不同种的找上3到4个。
8楼2013-03-29 09:25:09
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查看全部 8 个回答

fyjuan11

金虫 (正式写手)

对NCBI 数据库不熟悉,不知道怎么弄
2楼2013-03-15 20:23:49
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gqstar

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-29 16:11:50
ncbi 上blast一下,找几个同源性高的,下载下来,当参比序列。建树,我以前有搜集的全套方法,可惜电脑坏了,弄丢了
给你Ncbi blast 地址http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
回避型人格障碍
3楼2013-03-15 21:03:01
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fyjuan11

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gqstar at 2013-03-15 21:03:01
ncbi 上blast一下,找几个同源性高的,下载下来,当参比序列。建树,我以前有搜集的全套方法,可惜电脑坏了,弄丢了
给你Ncbi blast 地址http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&a ...

一般找几个就可以了呢?
4楼2013-03-15 21:04:40
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