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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 微生物鉴定之后怎么样建立系统发育树
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fyjuan11

金虫 (正式写手)

[求助] 微生物鉴定之后怎么样建立系统发育树

鉴定了三株曲霉之后，想要建立系统发育树，我查了资料，mega也会用了，但是关键是怎么样下载相同或相似的基因序列，下载什么样的基因序列，学化工的，不会这个呀，希望有经验的虫子帮个忙，非常感谢。。。
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1楼 2013-03-15 17:05:17
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fyjuan11

金虫 (正式写手)
对NCBI 数据库不熟悉，不知道怎么弄
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2楼2013-03-15 20:23:49
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gqstar

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-29 16:11:50
ncbi 上blast一下，找几个同源性高的，下载下来，当参比序列。建树，我以前有搜集的全套方法，可惜电脑坏了，弄丢了
给你Ncbi blast 地址http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
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回避型人格障碍
3楼2013-03-15 21:03:01
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fyjuan11

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gqstar at 2013-03-15 21:03:01
ncbi 上blast一下，找几个同源性高的，下载下来，当参比序列。建树，我以前有搜集的全套方法，可惜电脑坏了，弄丢了
给你Ncbi blast 地址http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&a ...

一般找几个就可以了呢？
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4楼2013-03-15 21:04:40
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gqstar

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by fyjuan11 at 2013-03-15 21:04:40
一般找几个就可以了呢？...

你不是三株菌，最少也得三个呀，每种找一两个就行了
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回避型人格障碍
5楼2013-03-15 21:06:26
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fyjuan11

金虫 (正式写手)
楼主，能不能加QQ？具体的教教我，实在不会。
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6楼2013-03-15 21:11:28
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hhz0104

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这是收藏的教程，与楼主共享一下
http://good.gd/2475826.htm
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7楼2013-03-17 15:52:26
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andyleier

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by fyjuan11 at 2013-03-15 21:04:40
一般找几个就可以了呢？...

找四五十个，地域性的、同源性高90%-100%不同属的或者同一属不同种的找上3到4个。
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8楼2013-03-29 09:25:09
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