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xiao2man

新虫 (初入文坛)

[求助] 不同来源的同种细菌血缘关系的鉴定

对n株不同来源的同种细菌（分子生物学鉴定结果），进行常规生理生化鉴定，有些鉴定项目表现出差异， 通过什么方式可以构建一种图，区分血缘关系的远近呢
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1楼 2013-01-09 15:52:23
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zjl01234

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你不是已经进行过分子生物学鉴定了嘛，是对16SRNA测序嘛?分析各菌种的这个序列构建个进化树就知道了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2013-01-10 10:47:43
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mizhoulong

木虫 (著名写手)

环境卫生、微生物学

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+3, 鼓励应助！ 2013-01-17 21:43:43
常规生理生化鉴定的结果有进行建树分析的方法吗？也许历史上有过，但现在没有见过单独用生理生化结果进行建树的。

现在的建树方法，最多的就是16S系统发育树，还有MADLI——TOF——MS蛋白质谱图法建树，还有其他的也依赖于各种检测仪器。

如用生化反应进行检测细菌的仪器，VITEKII等，出的结果实际上也是基于算法的，给出一个概率，但是这种算法是基于系统内部数据库的，没有单独的算法可用。
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环境卫生、微生物学、卫生应急
3楼2013-01-11 00:48:07
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xiao2man

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zjl01234 at 2013-01-10 10:47:43
你不是已经进行过分子生物学鉴定了嘛，是对16SRNA测序嘛?分析各菌种的这个序列构建个进化树就知道了

嗯 系统发育树和聚类图 都需要建
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4楼2013-01-17 21:39:56
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xiao2man

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mizhoulong at 2013-01-11 00:48:07
常规生理生化鉴定的结果有进行建树分析的方法吗？也许历史上有过，但现在没有见过单独用生理生化结果进行建树的。

现在的建树方法，最多的就是16S系统发育树，还有MADLI——TOF——MS蛋白质谱图法建树，还有其他 ...

嗯 是我描述不清楚 是建聚类图 和树状图差不多 现在的文献有Q聚类图 R聚类图 还有其他的方法可以产生聚类 有些文献 根据不同地区虾的 体高 体长 体重 等 建了聚类图 表示它们亲缘关系的远近
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5楼2013-01-17 21:43:00
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ycjiao88

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
rainwander: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-30 15:39:01
可采用MLST技术进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系。
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6楼2013-01-29 09:27:06
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