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bubble1220

银虫 (小有名气)

[求助] 大家帮我看看质粒肿木了?

我的质粒大小为2800bp,pUC18复制位点
第一次提取质粒并单酶切验证结果正确,图是这样的
1 质粒
2 单酶切,结果看起来是正确的,下面那条带认为是没有酶切完全的
质粒保存于-20度,2天后再拿出来酶切,结果图是这样的
3 质粒  没什么变成弥散的了?而且带型也和上次不一样了
4 单酶切  结果和上一次一样,但是这回下面那条带我就不认为是没切开的了,因为质粒上也有一条,到底下面那条带是什么啊?

未命名-2.jpg
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linzshit

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励积极发帖帮助解答问题 2013-02-26 18:12:23
amisking: 回帖置顶 2013-02-26 18:12:24
bubble1220: 金币+4, 有帮助 2013-02-28 08:36:02
个人感觉可能是质粒不纯,本身两条带,离的比较近,浓度大的时候不容易被看出来,所以234会在同一个位置留有条带,特别是34,貌似条带的深浅都是一样的。至于为啥弥散,可能是你第一次做的时候,不小心把酶飞进去了,从你的3位置的质粒高度与4位置的酶切高度相当可以推测,以上仅是个人推测。
7楼2013-02-26 16:37:51
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普通回帖

tianchunying

木虫 (正式写手)

★ ★
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2013-02-26 18:12:16
从图上看 你的胶应该是没有问题 问题可能出在你酶切那步  你看你2和4两次的结果都不一样 而且一般酶切都能切完全的  建议你加大内切酶的量  延长酶切时间
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
2楼2013-02-26 09:32:12
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tianchunying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
bubble1220: 金币+3, 有帮助 2013-02-28 08:36:15
从图上看 你的胶应该是没有问题 问题可能出在你酶切那步  你看你2和4两次的结果都不一样 而且一般酶切都能切完全的  建议你加大内切酶的量  延长酶切时间
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
3楼2013-02-26 09:32:28
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bubble1220

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tianchunying at 2013-02-26 09:32:12
从图上看 你的胶应该是没有问题 问题可能出在你酶切那步  你看你2和4两次的结果都不一样 而且一般酶切都能切完全的  建议你加大内切酶的量  延长酶切时间

谢谢,可是我怎么觉得2和4是一样的呢?
我的酶切体系中酶量为十分之一,酶切时间3h,以前都没有问题啊
4楼2013-02-26 09:34:32
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tianchunying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你2里的质粒加的多,4里的质粒量少,你酶切时间倒是不短,可以再延长到四个小时,内切酶的量加到十分之二试试
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
5楼2013-02-26 09:51:24
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tianchunying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你那个3号 我倒是觉得好奇怪  -20放两天应该没问题啊 不过酶切的东西有的时候就是很奇怪 总之 GOOD LUCK!
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
6楼2013-02-26 09:53:48
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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议你对质粒进行定量。一般鉴定酶切,需要的质粒量一般在500ng--1ug,就足够了,如果需要回收(尤其是回收小片段)时,则一般需要增加酶切的DNA量。
而酶切时,所需要的限制性内切酶的用量,很多人都是凭经验,但事实上,不同的酶,其活性单位定义都不一致。因而,凭经验,很容易出现酶切不完全的情况,我建议你用Doulbe digestion disigner 软件进行双酶切设计,该软件可以根据你酶切的DNA量以及你的限制性内切酶的供应商来精确计算酶切时所需要的酶量,免除优化酶切反应的烦劳。
我们公司购买其使用权,很方便。据说现在还可以免费试用,你可以试试。我在小木虫上推荐过,你应该可以搜到其链接。
祝好运。
8楼2013-02-26 22:18:09
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bingdong05

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
bubble1220: 金币+3, 有帮助 2013-02-28 08:34:21
一般酶切,20ul体系的话,酶加0.5就够了,当然具体还得看所用商品酶所含酶的单位,一般酶要稀释10倍以上,因为酶液里面所含有的甘油等成分会影响其活性,另外,楼主试试延长酶切时间
9楼2013-02-27 09:21:31
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damaomao

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

10楼2013-02-28 08:56:16
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