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luocongqiang

铁虫 (小有名气)

[求助] 测序比对结果

我提取了两株束丝藻基因,用27F和1492R这对引物PCR后测序、NCBI比对的结果是鱼腥藻,不知道为什么结果不是束丝藻,谢谢大家
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luocongqiang

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-14 03:09:52
你做的这两株藻种在NCBI的数据库里面有序列吗?此外,会不会是样品提取时候有污染?

如果数据库中没有是否比对结果也应该是同一属的呢,为什么是另一属呢,污染不知道有没有,但在显微镜下形态学上看应该是束丝藻,谢谢你问题
5楼2013-01-15 15:08:10
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查看全部 9 个回答

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你做的这两株藻种在NCBI的数据库里面有序列吗?此外,会不会是样品提取时候有污染?
2楼2013-01-14 03:09:52
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mizhoulong

木虫 (著名写手)

环境卫生、微生物学

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
27F和1492R不是16S rDNA的通用引物?原核的?

你这两株两株束丝藻是真核的吧?
环境卫生、微生物学、卫生应急
3楼2013-01-15 00:58:21
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mlanqiang

木虫之王 (文学泰斗)

蓝博士

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的这两株可能不是真核的。。。
蓝精灵
4楼2013-01-15 08:33:09
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