| 查看: 862 | 回复: 1 | ||||
zongzhiyou银虫 (初入文坛)
|
[求助]
求教NAMD安装的问题
|
|
各位大侠，请教一个比较弱弱的问题： 关于NAMD软件的安装，在官网上找到NAMD下载网页中列表如下 在Version 2.9 (2012-04-30) Platforms中有以下选项： Linux-x86 (32-bit Intel/AMD with ethernet) Linux-x86-TCP (TCP may be better on gigabit) Linux-x86_64-multicore (64-bit Intel/AMD single node) Linux-x86_64 (64-bit Intel/AMD with ethernet) Linux-x86_64-TCP (TCP may be better on gigabit) Linux-x86_64-ibverbs (InfiniBand via OpenFabrics OFED, no MPI needed) Linux-x86_64-ibverbs-smp (InfiniBand plus shared memory, no MPI needed) Linux-x86_64-multicore-CUDA (NVIDIA CUDA acceleration) Linux-x86_64-ibverbs-smp-CUDA (NVIDIA CUDA with InfiniBand) MacOSX-x86 (Mac OS X for Intel processors, fails on 10.7 "Lion"  MacOSX-x86_64 (Mac OS X for 64-bit Intel processors) Solaris-x86_64 Win32 (Windows XP, etc.) Win64-MPI (Windows HPC Server) Source Code 目前我的是XP 32bit 选择Win32 (Windows XP, etc.)下载，点击了namd2.exe提示如附件中的错误，在论坛里看到是缺少confi文件，那这个文件哪里去弄，求解答  [ Last edited by zongzhiyou on 2013-1-7 at 12:42 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 NAMD |
» 猜你喜欢
科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题
已经有12人回复
-
要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够
已经有17人回复
-
基金系统什么内容也没有
已经有10人回复
-
学科评审组评审是指会评吗？
已经有5人回复
-
梦想
已经有8人回复
-
面上合作单位盖章
已经有9人回复
-
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有17人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助关于namd中能量优化的一点疑问
已经有6人回复
- 求助namd的配置文件的修改，主要是如何添加约束
已经有5人回复
- 求教，安装过程出现配置文件错误
已经有2人回复
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- 本科新手，NAMD 做分子模拟，学习受阻，求教~~
已经有3人回复
- 安装aspen过程中遇到问题 求教高手
已经有8人回复
- [新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令
已经有9人回复
- 【求助】在NAMD运行中使用CHARMM格式的力场文件，但力场参数来自AMBER力场，会出问题�
已经有4人回复
- 求教，我安装的merck14th，前面使用几天ok，但是现在不行了
已经有7人回复
- 【求助】做NAMD的1K4C.pdb时候出现的错误
已经有30人回复
- 【求助】NAMD: water box时，立方水体的边界该怎样确定？先谢了
已经有4人回复
- 【求助】NAMD中的segment是什么意思？
已经有3人回复
- 【求助】LAMMPS、NAMD和CHARMM谁最适合生物大分子模拟？
已经有8人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】打算从amber学起
已经有16人回复
- 【求助】namd 出错Periodic cell has become too small for original patch grid!
已经有10人回复
- 【求助】Linux 下NAMD的单机版怎么安装？
已经有6人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
- 【求助】namd和vmd就只能识别.pdb.psf.coor.vel等文件吗
已经有6人回复
- 【求助】namd、vmd推荐个学习修改和编写脚本网站和地方吧
已经有3人回复
- 【求助】namd tutorial遇到问题
已经有10人回复
- 【求助】NAMD安装问题
已经有19人回复
fhh2626
木虫 (正式写手)
- 应助: 135 (高中生)
- 金币: 2354.1
- 红花: 7
- 帖子: 344
- 在线: 139小时
- 虫号: 1475956
- 注册: 2011-11-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-01-07 20:20:06
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-01-07 20:20:06
|
本来NAMD就没有图形界面的，不能点开 CONF文件是要自己写的，里面包含了你要计算的体系的各种信息 写完了之后用namd2 **.conf > **.log这类似的命令来进行计算 关于这个文件怎么写你可以看一下这个贴 http://muchong.com/html/201108/3516164.html |
2楼2013-01-07 13:53:57
30