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wu-ke-da

金虫 (小有名气)

学习的路上

[求助] PCR不出目的条带的原因

各位虫友们,小女子有问题想请教,望大家给出宝贵意见。
为什么PCR同一个基因,同一个模板,换了引物,但每次p出来的条带都在500左右的样子啊?目的条带是2000时,p出来的是500,目的条带是1500时,p出来也还是500,我们排除了引物、模板、酶、buffer等原因,退火温度也尽量低,但为什么还是得不到目的条带呢?
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喜欢生物,所以想好好研究下去!
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ccharlien

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by wu-ke-da at 2012-12-26 23:08:53
谢谢谢谢,但是为什么用别人以前做过的引物扩出来也是500呢?他成功扩出来了是2000...

那是挺好的结果啊
送去测序看看是不是你要的基因 比对一下
说不定这个样本就是有片段缺失的
你可以短消息我 这几天放假比较有空
8楼2012-12-26 23:51:05
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jimjohntall

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看一下延伸时间是不是改变了。这种情况我认为是引物的问题应该是引物没有设计好,易形成二聚体或者发卡结构引起的
2楼2012-12-26 18:37:27
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世外清风

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果美女排除了引物、模板、酶、buffer等原因,那么除了水,只有可能是你的引物设计上问题了。建议重新设一对引物扩扩看,同时那一对已知可用的引物扩一下做阳性对照,祝美女实验顺利!
3楼2012-12-26 18:40:17
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liudianlei

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引物设计的有问题
4楼2012-12-26 19:09:32
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