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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 无法解释的DNA凝胶电泳
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wuzijing06

新虫 (初入文坛)

[求助] 无法解释的DNA凝胶电泳

博士我最近投了一篇文章，其中一张凝胶电泳的照片被审稿人提出了疑问：
当使用的DNA双链和单链的长度分别为48bp，48nt的时候，单链比双链跑得快；
当使用的DNA双链和单链的长度分别为72bp，72nt的时候，双链比单链跑得快。
审稿人要求解释原因，各位有没有比较solid的说法？有无相关参考文献？
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1楼 2012-12-14 18:16:02
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zhaodahe

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我猜是不是和序列相关，48nt的单链会反向互补，自己就形成了更短的双链DNA , 而72nt的单链比较复杂，形成类似于开环质粒的结构，会更慢？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2012-12-14 19:14:16
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果要解决这个问题，可以跑一个8M变性的聚丙烯酰胺来展示，同意二楼的解释。
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行至水穷处，坐看云起时
3楼2012-12-15 17:34:47
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