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augusten

铁虫 (初入文坛)

[求助] DNA电泳凝胶成像系统条带很宽,都有哪些因素

平板电泳,1×TBE琼脂糖1.2%,有总DNA、50V,也有PCR产物、150V,都是等胶凉了以后先点样再放进电泳槽的。
VL Photo-print 215 SD成像系统。
出的条带都不是很干净的一条线,有点带点“凹”字形,有的就成了“口”字形了(接近点样孔的大小)。
帮忙分析下都可能会有哪些因素

总DNA






口字形
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若水5886

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的体系是:2ul样品+4ul溴酚蓝上样,溴酚蓝太多咯,这样会造成DNA挂壁的,也就是挂在胶上,跑的时候就容易出现凹陷的形状。loading buffer 一般有6*和10*的,你2ul样品+0.4ul loading buffer 上样就可以了,电压在60-140 v这样的效果都不错的,你可以试试

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4楼2012-02-22 09:54:21
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普通回帖

augusten

铁虫 (初入文坛)

补充说明一下
植物叶子提取的DNA,第一张没有稀释,第二张稀释的,第三张为PCR后的。
2ul样品+4ul溴酚蓝上样
2楼2012-02-21 17:19:38
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laojiu9878

至尊木虫 (文坛精英)

九牛

【答案】应助回帖

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用薄一点的梳子,电流不要太大。
但愿人长久
3楼2012-02-22 09:18:15
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augusten

铁虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by 若水5886 at 2012-02-22 09:54:21:
你用的体系是:2ul样品+4ul溴酚蓝上样,溴酚蓝太多咯,这样会造成DNA挂壁的,也就是挂在胶上,跑的时候就容易出现凹陷的形状。loading buffer 一般有6*和10*的,你2ul样品+0.4ul loading buffer 上样就可以了,电 ...

谢谢!
开始是4ul溴酚蓝,后来有减半,还是会有这种情况,包括Marker也会有。
先点样后入槽会不会有影响呢?等点好样,都干得差不多了。开始只是跟着师姐做,还没尝试先入槽后点样,但是感觉不方便啊。
5楼2012-02-22 16:31:23
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kidluag

金虫 (正式写手)

不自信的师生

引用回帖:
5楼: Originally posted by augusten at 2012-02-22 16:31:23:
谢谢!
开始是4ul溴酚蓝,后来有减半,还是会有这种情况,包括Marker也会有。
先点样后入槽会不会有影响呢?等点好样,都干得差不多了。开始只是跟着师姐做,还没尝试先入槽后点样,但是感觉不方便啊。

我们都是先入槽后点样的啊
被迫的无知小小博
6楼2012-02-23 00:24:55
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dingxiuying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
augusten(金币+3): ★有帮助 2012-02-23 10:33:07
正常的做法应该是先入槽,电泳缓冲液没过胶面,拔梳子,在槽中点样,这样电泳出来不会有什么问题。
我分析,你的问题出在先点样再入槽,一来样品容易干,二来如果拔梳子晚点儿的话,加样孔还容易损坏。另外,溴酚蓝不能太多,但是稍多点也不会影响电泳结果。
我喜欢默默地被你注视默默地注视着你,我喜欢深深地被你爱着深深地爱着你
7楼2012-02-23 09:15:13
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dingxiuying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

先入槽后点样简单的很。试试!
我喜欢默默地被你注视默默地注视着你,我喜欢深深地被你爱着深深地爱着你
8楼2012-02-23 09:16:09
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若水5886

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by augusten at 2012-02-22 16:31:23:
谢谢!
开始是4ul溴酚蓝,后来有减半,还是会有这种情况,包括Marker也会有。
先点样后入槽会不会有影响呢?等点好样,都干得差不多了。开始只是跟着师姐做,还没尝试先入槽后点样,但是感觉不方便啊。

你是这样上样的啊?建议你还是先入槽再上样。如果你觉得自己不熟练的话可以拿没有用的胶多练习,把loading buffer稀释了直接加孔里。
Marker也会有的话还可能和你用的梳子大小,电泳液浓度,电压大小有关呢
9楼2012-02-23 09:29:42
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augusten

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
楼: Originally posted by kidluag at 2012-02-23 00:24:55:
我们都是先入槽后点样的啊

我本科做实验是这么点的,但是现在这边点样量比较大,一般性的检测只要看到有条带、不会漂样就行了。
就是个人感觉那片子出来太难看了。
10楼2012-02-23 10:29:29
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