24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3274  |  回复: 12

watersr427

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR 溶解曲线乱、ct值高 怎么办

新手一枚,RT-PCR不理想,溶解曲线乱且ct值高,望各位高人指导!感激不尽!
脑组织RNA浓度 样本一:2200ng/ul 260/280 1.84;
样本二:11000ng/ul 260/280 1.94;
样本三:2400ng/ul 260/280 1.87;
第二天,调整浓度至1000ng/ul,逆转录
第三天,扩增
SYBR Premix Ex Taq II 10 ul
PCR Forward Primer 0.8 ul
PCR Reverse Primer 0.8 ul
DNA模版 2.0 ul
dH2O 6.4 ul
Total 20 ul

stage1:95℃ 30s 20℃/s
1 Cycle
stage2:95℃ 5s 20℃/s
62℃ 20s 20℃/s
40 Cycle

内参和目的ct值都在30以上
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

watersr427

新虫 (初入文坛)

不好意思,补上溶解曲线。望各位指点哈,该怎么办!

PCR 溶解曲线.png

2楼2012-10-19 13:25:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ct在30以上问题并不是很大,虽然比较理想的情况是20-30直接。你的熔解曲线问题很大。熔解温度低的是引物二聚体,温度高的可能有分子量较大其它产物。问一下你做没有做负对照(反转时不加逆转录酶的样品)?样品的A260/280低,有DNA污染。感觉是DNase酶消化没做好。
3楼2012-10-19 14:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

watersr427

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-19 14:53:16
ct在30以上问题并不是很大,虽然比较理想的情况是20-30直接。你的熔解曲线问题很大。熔解温度低的是引物二聚体,温度高的可能有分子量较大其它产物。问一下你做没有做负对照(反转时不加逆转录酶的样品)?样品的A2 ...

没做过负对照。我是新手很多都不懂,麻烦再问哈,如果DNA污染还有什么方法补救没,因为标本很珍贵呀!
4楼2012-10-19 15:41:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by watersr427 at 2012-10-19 15:41:56
没做过负对照。我是新手很多都不懂,麻烦再问哈,如果DNA污染还有什么方法补救没,因为标本很珍贵呀!...

你提的RNA样品定量后重新做DNase消化。消化后做反转录。反转的同时做无反转录酶的对照,做real-time PCR时也跑负对照样品,可以确定样品中是否残留基因组DNA。
5楼2012-10-20 06:28:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

watersr427

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-20 06:28:42
你提的RNA样品定量后重新做DNase消化。消化后做反转录。反转的同时做无反转录酶的对照,做real-time PCR时也跑负对照样品,可以确定样品中是否残留基因组DNA。...

非常感谢,我再试试!
6楼2012-10-20 22:27:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyt88

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by watersr427 at 2012-10-19 15:41:56
没做过负对照。我是新手很多都不懂,麻烦再问哈,如果DNA污染还有什么方法补救没,因为标本很珍贵呀!...

你好,我想问一下,反转录时候的无反转录酶对照和定量时的负对照体系里都加什么呢?
7楼2012-12-11 21:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyt88

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-20 06:28:42
你提的RNA样品定量后重新做DNase消化。消化后做反转录。反转的同时做无反转录酶的对照,做real-time PCR时也跑负对照样品,可以确定样品中是否残留基因组DNA。...

负对照是以RNA为模板吗?
8楼2012-12-11 21:58:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by zyt88 at 2012-12-11 21:58:41
负对照是以RNA为模板吗?...

负对照是指RNA样品反转录合成cDNA时不加酶的样品对照,实际上是RNA。理论上这些样品是没有扩增的。如果RNA里残留有DNA就会批出来。负对照不行的样品不能用,需要重做DNA消化。
9楼2012-12-12 07:53:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-12-12 07:53:15
负对照是指RNA样品反转录合成cDNA时不加酶的样品对照,实际上是RNA。理论上这些样品是没有扩增的。如果RNA里残留有DNA就会批出来。负对照不行的样品不能用,需要重做DNA消化。...

我有个小小的问题,因为RNA是及其不稳定的,用没有逆转录的RNA作为模板这个时候RNA是不是已经降解了呢?
keepon
10楼2012-12-12 08:23:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 watersr427 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博/考博 +3 啃面包的小书虫 2026-04-17 4/200 2026-04-17 23:54 by 阳阳阳^_^
[考研] 320求调剂 +4 深郊akm 2026-04-17 4/200 2026-04-17 17:32 by 一切OK
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +6 小蜗牛* 2026-04-16 6/300 2026-04-17 10:05 by 涵竹刘
[考研] 300求调剂 +11 橙a777 2026-04-15 11/550 2026-04-16 22:43 by cfdbai
[考研] 294求调剂 +14 淡然654321 2026-04-15 14/700 2026-04-16 21:01 by lpl364211
[考研] 307中医考研调剂 +6 于以采蘩 2026-04-14 6/300 2026-04-16 16:20 by qingfeng258
[考博] 申博自荐 +3 Linxia林夏 2026-04-13 3/150 2026-04-16 12:55 by 墨荷之露
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 药学求调剂 +11 RussHu 2026-04-12 13/650 2026-04-15 19:07 by zhuwenxu
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +19 电气李 2026-04-13 21/1050 2026-04-15 13:37 by 黑科技矿业
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
[考研] 材料考研调剂 +29 云木达达 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 13:32 by lyh鲁老师
[考研] +10 李多米lee. 2026-04-12 11/550 2026-04-12 22:58 by yuyin1233
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 331求调剂 +5 王国帅 2026-04-11 5/250 2026-04-11 22:56 by 溪涧流水
[考研] 270求调剂 +14 杨乐369 2026-04-11 14/700 2026-04-11 20:16 by 蓝云思雨
[考研] 调剂 +5 文道星台 2026-04-11 5/250 2026-04-11 15:01 by 凯凯要变帅
信息提示
请填处理意见