24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3243  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

watersr427

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR 溶解曲线乱、ct值高 怎么办

新手一枚,RT-PCR不理想,溶解曲线乱且ct值高,望各位高人指导!感激不尽!
脑组织RNA浓度 样本一:2200ng/ul 260/280 1.84;
样本二:11000ng/ul 260/280 1.94;
样本三:2400ng/ul 260/280 1.87;
第二天,调整浓度至1000ng/ul,逆转录
第三天,扩增
SYBR Premix Ex Taq II 10 ul
PCR Forward Primer 0.8 ul
PCR Reverse Primer 0.8 ul
DNA模版 2.0 ul
dH2O 6.4 ul
Total 20 ul

stage1:95℃ 30s 20℃/s
1 Cycle
stage2:95℃ 5s 20℃/s
62℃ 20s 20℃/s
40 Cycle

内参和目的ct值都在30以上
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

watersr427

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-19 14:53:16
ct在30以上问题并不是很大,虽然比较理想的情况是20-30直接。你的熔解曲线问题很大。熔解温度低的是引物二聚体,温度高的可能有分子量较大其它产物。问一下你做没有做负对照(反转时不加逆转录酶的样品)?样品的A2 ...

没做过负对照。我是新手很多都不懂,麻烦再问哈,如果DNA污染还有什么方法补救没,因为标本很珍贵呀!
4楼2012-10-19 15:41:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

watersr427

新虫 (初入文坛)

不好意思,补上溶解曲线。望各位指点哈,该怎么办!

PCR 溶解曲线.png

2楼2012-10-19 13:25:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ct在30以上问题并不是很大,虽然比较理想的情况是20-30直接。你的熔解曲线问题很大。熔解温度低的是引物二聚体,温度高的可能有分子量较大其它产物。问一下你做没有做负对照(反转时不加逆转录酶的样品)?样品的A260/280低,有DNA污染。感觉是DNase酶消化没做好。
3楼2012-10-19 14:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by watersr427 at 2012-10-19 15:41:56
没做过负对照。我是新手很多都不懂,麻烦再问哈,如果DNA污染还有什么方法补救没,因为标本很珍贵呀!...

你提的RNA样品定量后重新做DNase消化。消化后做反转录。反转的同时做无反转录酶的对照,做real-time PCR时也跑负对照样品,可以确定样品中是否残留基因组DNA。
5楼2012-10-20 06:28:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工专硕306分找合适调剂 +27 沧海轻舟e 2026-04-06 28/1400 2026-04-08 22:06 by wdyheheeh
[考研] 318求调剂 +13 ykyhsa 2026-04-05 15/750 2026-04-08 21:37 by wj165256
[考研] 环境专硕调剂 +15 会说话的肘子 2026-04-06 15/750 2026-04-08 18:56 by 环化材-小生
[考研] 281求调剂 +10 椰子蘑菇 2026-04-06 10/500 2026-04-08 11:43 by zzucheup
[考研] 材料专硕322分 +12 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-02 12/600 2026-04-08 11:43 by 1753564080
[考研] 312 化工或制药调剂 +9 小小墨123 2026-04-02 10/500 2026-04-08 10:30 by screening
[考研] 274求调剂 +4 山阿蔓 2026-04-07 4/200 2026-04-08 09:49 by eyeliyang
[考研] 生物医药调剂|SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 259求调剂 +5 就爱吃土豆呀呀 2026-04-07 5/250 2026-04-07 22:40 by JourneyLucky
[考研] 22408 调剂材料 +7 我叫ez 2026-04-06 8/400 2026-04-07 17:12 by 蓝云思雨
[考研] 325 调剂 +6 QQ小虾 2026-04-07 6/300 2026-04-07 15:17 by Ccclqqq
[考研] 307求调剂 +3 所念及所望 2026-04-06 3/150 2026-04-06 17:30 by 土木硕士招生
[考研] 085600,320分求调剂 +16 大馋小子 2026-04-04 17/850 2026-04-06 07:58 by MOF_Catal
[考研] 化学357分,考研调剂 +11 .Starry. 2026-04-04 12/600 2026-04-06 06:28 by houyaoxu
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 313求调剂 +3 海日海日 2026-04-04 3/150 2026-04-05 07:48 by 544594351
[考研] 能动调剂326专硕 +4 wan112233 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:47 by yu221
[考研] 321求调剂 +13 认真求上学 2026-04-02 13/650 2026-04-04 18:23 by macy2011
[考研] 313求调剂 +3 ~微微凉~ 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:25 by 啵啵啵0119
[考研] 求调剂 302分初试 0854 +5 伶可乐 2026-04-02 5/250 2026-04-02 17:53 by 笔落锦州
信息提示
请填处理意见