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ruililian09

银虫 (小有名气)

[求助] 我有几个克隆和基因重组的基本问题不太清楚,请各位帮帮忙!

1、DH5α和JM109这两个菌株在做克隆时有什么区别,我看的文章里,做克隆时两者都用。
2、做转化时,我看文献里都会用X-Gal和IPTG来做蓝白斑筛选,但是我们用T载连接转化到DH5α中的时候,是不用蓝白斑来筛选的,出现阳性菌落的时候就挑单菌落做菌落PCR验证,这样是不是就可以代替蓝白斑筛选了,甚至比前者更有说服力?
3、用BL21和毕赤酵母表达时,一般用什么酶与载体连接呢?我的理解是根据设计引物时加的酶切位点来定,可不知道为什么老师还让我查。
4、做易错PCR和DNA Shuffling时怎么确定重组的条件呢?例如:PCR体系,程序,内切酶和无引物PCR的程序等等。或者摸索重组条件的时候的依据有哪些?易错PCR是将突变的碱基控制在一定的范围之内吗,那不是没摸索一次就要测一次序?
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ruililian09

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Happy实验室 at 2012-10-02 22:54:53
第四个问题:可以考虑设计带有突变位点的大片段引物,然后将片段放在一起杂交,也可以做到

设计带有突变位点的引物对酶的结构和功能要比较熟悉才行吧?我打算做的就是随机的突变,是不是行不通呢?
7楼2012-10-07 12:46:08
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查看全部 7 个回答

ysn5048

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
回答楼主第二个问题,蓝白斑可以大量排除假阳性,减少后续工作量,建议楼主使用蓝白斑筛选
有时候,一句话,可以改变未来
2楼2012-09-28 10:59:50
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gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 回帖置顶 2012-09-28 11:32:20
1949stone: MolEPI+1, ok 2012-09-28 11:32:27
1、 DH5a是一种常用于质粒克隆的菌株。E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体转化时,可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补。可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。JM109菌株在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时,由于载体DNA产生的LacZa多肽和JM09编码的LacZΔM15进行α-互补,从而显示β-半乳糖苷酶活性,由此很容易鉴别重组体菌株。
2、严格来说,蓝白斑筛选还是要做的,筛选出白班之后再做PCR验证,这样假阳性概率就小。
3、选择酶切位点很重要,不光要切下来,下一步还要能连接上去,查阅文献是对的,好好筛选,挑选常见的,经济的,连接效率高的。
持之以恒、永不放弃!
3楼2012-09-28 11:12:46
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 很好 2012-09-28 17:19:34
BL21表达我是用pET-28a(+),毕赤酵母没做过。做不做蓝白斑筛选可以根据你的情况而定。假阳性多的时候最好做。可能是我比较懒吧,通常是做菌落PCR筛。即使做了菌落PCR,还是要再提质粒酶切鉴定的。
4楼2012-09-28 15:01:02
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