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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 做微卫星分析电泳条带怎么分析？
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lt7912

金虫 (小有名气)

[交流] 做微卫星分析电泳条带怎么分析？

我这段时间要做鼠类的微卫星，用做种内分析，因为以前从来没接触过动物方面的微卫星，求教一下高手有没有写的详细一些的文章好做参考？由于没有所做的鼠的全基因组序列，就在大鼠和小鼠的序列上找了一些微卫星位点用PCR筛选，PCR筛选出有条带的引物用于下一步微卫星分析，看文献主要的方法好像就是非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，还有一种是用ABI的仪器不知道是不是毛细管电泳？后面怎么分析？我做的量比较大，求教高手那种方法好一点？有没有具体的文献或者书能不能介绍一下？谢谢！
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1楼 2012-07-31 20:02:20
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lt7912

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ZOEY21 at 2012-08-01 09:12:43
本人也刚开始做微卫星，过来跟楼主交流下。微卫星分析可以用聚丙烯酰胺凝胶电泳也可以用荧光标记引物做微卫星分型。聚丙烯跑胶需要摸索条件，工作量大一点；荧光分型有仪器的话自己可以做，但好像比较麻烦，我不会， ...

我现在用大鼠，小鼠，还有其他一些鼠类设计好的引物做PCR摸索出一些引物可能能用，又优化了一下反应条件和Mg2+浓度，跑胶用的是1.5%的琼脂糖凝胶，再往后做可能就要用聚丙烯酰胺电泳了。。。总觉得那样做太费事了，一块胶跑不了多少个样。那你们送那个公司？大概需要多少钱？
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4楼2012-08-03 12:24:52
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ZOEY21

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+3, 鼓励积极交流经验哦 2012-08-01 13:56:19
lt7912: 金币+5 2012-08-03 12:15:14
本人也刚开始做微卫星，过来跟楼主交流下。微卫星分析可以用聚丙烯酰胺凝胶电泳也可以用荧光标记引物做微卫星分型。聚丙烯跑胶需要摸索条件，工作量大一点；荧光分型有仪器的话自己可以做，但好像比较麻烦，我不会，所以送公司分型，那工作量就只有PCR那么一点点。后续的结果处理按工作量来说二者就差不多了。但聚丙烯酰胺凝胶电泳会出现影子带什么的问题，对有选择障碍的人来说比较纠结。
啰啰嗦嗦这么多，请楼主不要嫌烦啊。
PS.这方面文献倒挺多的，不清楚的话找几篇博士论文先看着。祝楼主好运！
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2楼2012-08-01 09:12:43
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凤凰-涅磐

金虫 (著名写手)
★
lt7912: 金币+1, 谢谢参与！ 2012-08-03 12:26:32
不太清楚，只是过来逛逛
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3楼2012-08-01 09:22:02
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lt7912

金虫 (小有名气)
有没有人知道，纯合子和杂合子在分型中起到什么作用？
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6楼2012-08-06 23:44:21
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