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引物设计中的一点小问题
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胡乱走走2011
银虫
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虫号: 1453727
[交流]
引物设计中的一点小问题
如图中所示,设计引物时,经常会出现false priming,有时候很难避免,右上角出现的product=2381,代表什么?是非特异扩增产物的长度吗?
有时候还是会有错配,但是product=0,又代表什么意思?
请指教,谢谢。
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1楼
2012-07-10 10:23:17
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新虫
(初入文坛)
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虫号: 1448383
在给线粒体序列进行分区时候,有的人用RY-coding即12n3rRTn,哪位大侠知道是怎样分的?很是纠结啊
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8楼
2012-10-07 14:16:04
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roomofxw
木虫
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★ ★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流
2012-07-10 13:47:38
只是PCR扩增的话,保证错配引物尽量不出现3末端互补,或者既是互补少于8个也可以尝试。
你这个再延长一下引物试一试?
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2楼
2012-07-10 11:09:14
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分子菜鸟
木虫
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虫号: 1334847
★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
那个真没注意过。括号里是引物错配的位点,楼主可以自己推测一下错配的片段大小
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3楼
2012-07-11 08:22:00
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木虫
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(高中生)
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在线: 986.6小时
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★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
错配产物长度,扩增的时候不一定出现.长度为0一般是引物间没有形成扩增区,比如上游引物在下游引物的右边.
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4楼
2012-07-11 10:45:36
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