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胡乱走走2011

银虫 (著名写手)

[交流] 引物设计中的一点小问题

如图中所示，设计引物时，经常会出现false priming，有时候很难避免，右上角出现的product=2381，代表什么？是非特异扩增产物的长度吗？
有时候还是会有错配，但是product=0，又代表什么意思？
请指教，谢谢。
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1楼 2012-07-10 10:23:17
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roomofxw

木虫 (正式写手)
★ ★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-10 13:47:38
只是PCR扩增的话，保证错配引物尽量不出现3末端互补，或者既是互补少于8个也可以尝试。
你这个再延长一下引物试一试？
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2楼2012-07-10 11:09:14
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分子菜鸟

木虫 (小有名气)
★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
那个真没注意过。括号里是引物错配的位点，楼主可以自己推测一下错配的片段大小
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3楼2012-07-11 08:22:00
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547star

木虫 (著名写手)
★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
错配产物长度,扩增的时候不一定出现.长度为0一般是引物间没有形成扩增区,比如上游引物在下游引物的右边.
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4楼2012-07-11 10:45:36
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jl860822

金虫 (正式写手)
★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
product=2381是指错配产物的长度，product=0是指错配不能产生错配产物
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5楼2012-07-11 13:32:17
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780871756

新虫 (初入文坛)
★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
没事的，，，放心做吧，
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6楼2012-07-11 15:32:11
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燕子9883

铜虫 (初入文坛)
★
胡乱走走2011(金币+1): 谢谢参与
没问题的，长度够了。
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7楼2012-07-11 22:49:55
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780871756

新虫 (初入文坛)
在给线粒体序列进行分区时候，有的人用RY-coding即12n3rRTn，哪位大侠知道是怎样分的？很是纠结啊
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8楼2012-10-07 14:16:04
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