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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】求助，引物设计中的问题
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周半仙

木虫 (小有名气)

探索者

[交流] 【求助/交流】求助，引物设计中的问题 已有5人参与

引物设计时，在NCBI中搜寻相近物种的相同基因序列，发现同一物种的搜索结果很多，其中既有cDNA又有mRNA序列，而且还有很多不同长度的，怎么选择用哪一个来设计引物？新手上路，请各位大虾指点迷津！

[ Last edited by dhd997 on 2010-11-19 at 10:04 ]
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1楼 2010-08-18 16:58:50
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遨游生命

铁杆木虫 (正式写手)
★
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都一样的。mRNA也是成熟加工后的测序，他的反转录就是cDNA，用cDNA 直接就可以PCR，用mRNA需要反转录后在进行PCR，引物都是一样的。
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2楼2010-11-18 22:56:21
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wxf8470

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
首先要弄清楚目的基因的长度，如由多少个氨基酸组成，可能需要看目的基因已发表的文献来确定其长度。NCBI上同一个基因为不同的实验室提交，可能有不同的版本，序列长度有的不一样。
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3楼2010-11-18 23:12:07
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ljsh

铁杆木虫 (著名写手)
选用最新提交的。
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4楼2010-11-19 04:31:17
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yqhc

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
根据自己需要，也可以通过软件设计primer
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5楼2010-11-19 07:42:08
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wangy0908

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
都可以的啊，主要看你像扩增说明片段以及多大的片段的。cDNA以及mRNA都可以用来设计！
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6楼2010-11-19 08:26:09
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