24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1800  |  回复: 11

hraikeyan

金虫 (小有名气)

[求助] 克隆目的基因

一直在从一个全基因组不知道的菌种克隆目的基因,最近根据同源性设计了兼并引物。现在遇到了以下这些问题:
1.用兼并引物P目的片段时,使用梯度PCR做的,确定退火温度在58—65之间都有条带,最后回收胶,做连接,转化,蓝白斑筛选,挑了18个白斑进行菌落PCR,发现没有目标条带。(注:因为是新手,切胶回收时切得有些宽,师姐说可能回收率太低)
2.介于上次失败,所以就从头开始做一次克隆,所选的退火温度是62℃。但是这次居然没有P出来。只有一条很淡的条带,这也没法回收啊。
所以请高手指点一下啦。万分感谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

nothing isimpossible
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hraikeyan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by trizol11 at 2012-05-28 12:51:13
楼主,你的菌液PCR的反应条件可以给我不?谢谢

我做的是菌落PCR。
95℃      5min
95℃      1min   30个 循环
63℃      1min   30个循环
72℃       1min30s    30个循环
72℃      10min
4℃        ------
nothing isimpossible
8楼2012-05-28 21:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
hraikeyan: 金币+1, 有帮助 2012-05-28 21:36:03
菌落PCR有时P不出来...可以直接提质粒验证...
2楼2012-05-28 00:45:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-28 21:56:52
只有一条很淡的条带,这也没法回收啊...这种情况可以再次PCR...直接P的足够量,现在各种pfu价格都不是很高,继续做...
3楼2012-05-28 00:47:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maoyong

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-28 16:01:13
hraikeyan: 金币+1 2012-05-28 21:36:13
(1)菌落PCR只能做初步判断,最好是直接提质粒再检测;
(2)条带太弱的话,可以把退火温度调一下,或是做二次回收
4楼2012-05-28 08:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yinchu1990

铜虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
菌落PCR不好  最好提质粒验证
5楼2012-05-28 09:01:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

trizol11

木虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 应助指数-1, 这个不算应助哈 2012-05-28 21:57:14
楼主,你的菌液PCR的反应条件可以给我不?谢谢
任重道远……
6楼2012-05-28 12:51:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasonwyb123

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流 2012-05-28 16:01:25
hraikeyan: 金币+2 2012-05-28 21:40:26
你这种情况很正常,需要多尝试一下
第一,你不一定就局限于62°,可以换一个,
第二,切胶时尽量少切没用的空白胶,我有个师兄号称是“刘三刀”,因为再难看的胶他三刀之内都切的不错,可以学习这个,反正尽量把胶切薄,切少
第三,聚落pcr效率有点差,你可以用1ml的管子小摇一下,37°估计2~3h就差不多了吧,具体忘记了,之后菌液p或者抽质粒再做
7楼2012-05-28 14:34:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

trizol11

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by hraikeyan at 2012-05-28 21:40:08
我做的是菌落PCR。
95℃      5min
95℃      1min   30个 循环
63℃      1min   30个循环
72℃       1min30s    30个循环
72℃      10min
4℃        ------...

谢谢,战友
任重道远……
9楼2012-05-29 12:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无踪无影

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+2, Good! 2012-05-29 18:56:26
可以把PCR产物浓缩之后再跑电泳胶回收,十分之一醋酸钠,两点五倍酒精,混合1小时以上-20度,洗涤之后溶于水中,溶水的量自己定吧
一切皆有可能
10楼2012-05-29 15:52:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hraikeyan 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +6 yexuqing 2026-04-19 7/350 2026-04-23 12:32 by yexuqing
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +18 花田半亩~白 2026-04-21 18/900 2026-04-23 11:31 by 12021227
[考研] 有没有学校收留 +3 蒋昌鹏qtj 2026-04-20 3/150 2026-04-22 20:25 by 学员JpLReM
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见