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[交流]
怎么能让amber识别钙离子？ 已有1人参与
最近用amber做一下发光蛋白的qmmm
里面存在着形成配位键的钙离子
由于Ca的书写形式
amber总是不认识
上网查了一个钙离子的信息
Adding Calcium ion
1. Downloading（metal.prp and metal.mpg） from Amber webside
2. Modify the name of atom in pdb file. 原子名改为 KA
3. The following is the tleap.in (我用的是tleap)
可是改了KA之后
xleap就认为变成了钾了
定义配位键根本就不好使
请问怎么能让amber认识钙呢？
刚刚学习
问的肤浅的话请见谅
您的一句话可能就帮了我的大忙
各位高手帮帮忙给看看呗
谢谢了 |
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