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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ValYu

银虫 (小有名气)


[交流] Amber如何分析疏水作用?

Amber缺乏定义平面的能力,因此想通过测定两共轭面夹角跟踪π-π堆积作用似乎变得很困难,有没有什么替代的办法呢?
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3楼2012-06-22 12:16:24
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ValYu

银虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2012-06-22 12:16:24
我想问一个问题:什么是疏水作用?

两个疏水基团会靠的比较近呗,如果是芳环之间可能有π-π堆积作用,主要的推动力还是外面的水能够多形成一些氢键吧
4楼2012-06-23 23:30:38
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匿名

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5楼2012-06-24 13:38:32
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ValYu

银虫 (小有名气)


引用回帖:
5楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2012-06-24 13:38:32
你的回答太浅显了,如果你感兴趣,这个问题可以深究下去。疏水作用是什么?这是个业内还没有完全回答的问题。大家都说是疏水的两个东西会靠近,但是没人很好地从本质上解决它。...

疏水作用还这么复杂啊,不就是一个焓有利熵不利因而是一个焓驱动的过程吗……我还听说过有人用渗透压来解释的。不过我也不是研究理论的,我本来的意思还是研究两个芳环之间的疏水作用,应当考虑两个环的二面角,而amber似乎没有这样的分析工具
6楼2012-06-25 00:56:32
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匿名

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7楼2012-06-25 11:01:38
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2012-06-21 21:03   回复  
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