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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Amber如何分析疏水作用？
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ValYu

银虫 (小有名气)

[交流] Amber如何分析疏水作用？

Amber缺乏定义平面的能力，因此想通过测定两共轭面夹角跟踪π-π堆积作用似乎变得很困难，有没有什么替代的办法呢？
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1楼 2012-06-21 20:44:35
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匿名

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7楼2012-06-25 11:01:38
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匿名

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3楼2012-06-22 12:16:24
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ValYu

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2012-06-22 12:16:24
我想问一个问题：什么是疏水作用？

两个疏水基团会靠的比较近呗，如果是芳环之间可能有π-π堆积作用，主要的推动力还是外面的水能够多形成一些氢键吧
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4楼2012-06-23 23:30:38
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匿名

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jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-06-24 15:13:39
ValYu: 金币+2, 感谢参与！ 2012-06-25 00:51:55
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5楼2012-06-24 13:38:32
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