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chlamy

木虫 (小有名气)

[求助] 菌液PCR呈阳性,但质粒做PCR却做不出来

各位虫友:

最近用做酶切连接,挑克隆。用煮沸的菌液上清做PCR的模板,质粒上特有序列做引物,能够扩增出来。并且以这次的扩增产物为模板,再用其中内部的一对引物进行PCR,也能扩增出目的条带出来,但我用提取的质粒做PCR的模板时就是P不出来,这是怎么回事呢?请高手指点……
先谢过。
注:已经试过DH5a和JM109两种菌株,
自己猜测过是不是整合到基因组上去了,加热煮沸菌体的上清中混有细菌的基因组DNA,故菌液可以扩增出,但质粒不可以啊。
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chlamy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-04-29 00:10:11:
嗯.....................
       我觉得啊,没那么复杂,你可先试试双酶切,看能不能把切下你的PCR条带,或你PCR产物上有质粒上没有的酶切位点是否酶切后正常线性化,要是实在头疼,建议送测,正反一个反应确定是 ...

3楼2012-04-29 00:32:24
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chlamy: 金币+1, 有帮助 2012-04-29 00:32:36
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-04-29 15:33:22
chlamy: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-06-21 11:40:37
嗯.....................
       我觉得啊,没那么复杂,你可先试试双酶切,看能不能把切下你的PCR条带,或你PCR产物上有质粒上没有的酶切位点是否酶切后正常线性化,要是实在头疼,建议送测,正反一个反应确定是你的东西就可以了
       PCR太诡异,一切都不好说............
       个人看法 若有说错请高手指点
Let God do with it as He wills
2楼2012-04-29 00:10:11
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