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rebornpro

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求高手设计简并引物 已有1人参与

RT,里面有18个属于一类蛋白家族的基因序列和相应的氨基酸序列(都用txt格式存的),有没有高手能帮忙分析下,看能设计出简并引物来否?
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  • 附件 1 : PS碱基序列.rar
  • 2012-04-27 21:13:09, 18.39 K
  • 附件 2 : PS氨基酸序列.rar
  • 2012-04-27 21:13:13, 10.81 K

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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
说实话 我成功过两回 是用codhop做的 你大可自己尝试一下
2楼2012-04-27 21:35:15
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cxfans at 2012-04-27 21:35:15:
说实话 我成功过两回 是用codhop做的 你大可自己尝试一下

谢谢。
3楼2012-04-27 21:47:38
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cxfans at 2012-04-27 21:35:15:
说实话 我成功过两回 是用codhop做的 你大可自己尝试一下

谢谢。
4楼2012-04-27 21:48:50
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yanfeier

金虫 (小有名气)

我下载下来你的序列  没有明白,你是所有的序列一起设计简并引物还是怎么样,我可能理解能力差点。我以前大概是用10-15条氨基酸序列设计的简并引物,总共设计了6对。实验效果还可以。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2012-04-28 14:20:53
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by yanfeier at 2012-04-28 14:20:53:
我下载下来你的序列  没有明白,你是所有的序列一起设计简并引物还是怎么样,我可能理解能力差点。我以前大概是用10-15条氨基酸序列设计的简并引物,总共设计了6对。实验效果还可以。

谢谢,18个序列,如果能一起设计出简并引物的话那是最好不过了,如果设计不出,尽量几个在一起设计简并引物也是可以的,怎么省钱怎么来嘛。设计不出来的话那我只能每类基因分别设计保守区的引物了。
6楼2012-04-28 15:54:38
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huihui9467

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以用DNAMAN进行保守氨基酸及核酸序列多重比对,然后在premier5.o中进行引物设计。
7楼2014-08-06 22:28:22
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