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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求高手设计简并引物
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求高手设计简并引物 已有1人参与

RT，里面有18个属于一类蛋白家族的基因序列和相应的氨基酸序列（都用txt格式存的），有没有高手能帮忙分析下，看能设计出简并引物来否？
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  • 附件 1 : PS碱基序列.rar
    • 2012-04-27 21:13:09, 18.39 K
  • 附件 2 : PS氨基酸序列.rar
    • 2012-04-27 21:13:13, 10.81 K

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1楼 2012-04-27 21:15:15
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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
说实话 我成功过两回 是用codhop做的 你大可自己尝试一下
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2楼2012-04-27 21:35:15
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cxfans at 2012-04-27 21:35:15:
说实话 我成功过两回 是用codhop做的 你大可自己尝试一下

谢谢。
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3楼2012-04-27 21:47:38
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cxfans at 2012-04-27 21:35:15:
说实话 我成功过两回 是用codhop做的 你大可自己尝试一下

谢谢。
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4楼2012-04-27 21:48:50
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yanfeier

金虫 (小有名气)
我下载下来你的序列  没有明白，你是所有的序列一起设计简并引物还是怎么样，我可能理解能力差点。我以前大概是用10-15条氨基酸序列设计的简并引物，总共设计了6对。实验效果还可以。
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rebornpro
5楼2012-04-28 14:20:53
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rebornpro

铁虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by yanfeier at 2012-04-28 14:20:53:
我下载下来你的序列  没有明白，你是所有的序列一起设计简并引物还是怎么样，我可能理解能力差点。我以前大概是用10-15条氨基酸序列设计的简并引物，总共设计了6对。实验效果还可以。

谢谢，18个序列，如果能一起设计出简并引物的话那是最好不过了，如果设计不出，尽量几个在一起设计简并引物也是可以的，怎么省钱怎么来嘛。设计不出来的话那我只能每类基因分别设计保守区的引物了。
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6楼2012-04-28 15:54:38
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huihui9467

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以用DNAMAN进行保守氨基酸及核酸序列多重比对，然后在premier5.o中进行引物设计。
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7楼2014-08-06 22:28:22
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