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晓婧happy

铜虫 (初入文坛)


[交流] PCR产物再进行PCR

大家有木有做过PCR回收产物为模板扩增目的基因啊?我听说是可行的,可我们老师说不稳定,很不稳定,大家给个意见吧,谢谢
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ouyangtao0102

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西瓜: 金币+2, Good! 2012-04-12 23:46:04
非常同意虫友“gaoyang636”所说的。不同引物的话基本没问题,可以扩增出来,如果第二轮PCR用的是同一对引物的话有的时候可以扩出来,但有的时候是一片涂抹带。如果第二轮用的不是同一对引物,不需要特意去提高退火温度,按照你的这对引物的退火温度去扩增就是了。
10楼2012-04-12 21:53:27
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dfl204

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★ ★
晓婧happy(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+2, Good! 2012-04-12 23:45:14
如果第一轮PCR产物量很低的话可以用来作为下一轮PCR的模板。
巢氏PCR都是经过两轮扩增的。

用高保值度的酶和较高的退火温度是可以基本保证产物的特异性的。
5楼2012-04-12 16:01:08
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★
晓婧happy(金币+1): 谢谢参与
amisking: 金币+3, 鼓励帮助解答,欢迎继续交流。 2012-04-12 17:54:23
西瓜: 回帖置顶 2012-04-12 23:45:25
有一个问题你没说清楚:PCR产物回收后做模板再次进行PCR,那么这个第二轮 PCR的引物是另一套,还是相同的引物?
如果是另一套,比如内测引物,这种nested-PCR没问题,并且常常使用;
而如果是相同引物,的确不稳定:
产物做模板的浓度需要摸索;由于Taq酶的不保真引起的产物轻微差别也会有不利影响等等;所以说,可以考虑将回收产物转化并筛菌,拿菌液做模板,就很容易了
6楼2012-04-12 16:03:57
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晓婧happy

铜虫 (初入文坛)


西瓜: , 绝对可行! 2012-04-12 23:45:48
引用回帖:
6楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-04-12 16:03:57:
有一个问题你没说清楚:PCR产物回收后做模板再次进行PCR,那么这个第二轮 PCR的引物是另一套,还是相同的引物?
如果是另一套,比如内测引物,这种nested-PCR没问题,并且常常使用;
而如果是相同引物,的确不稳 ...

不是相同的引物,是想从得到的基因片段上再扩增出一部分片段,这样是可行的吧?我现在也做了转化了,以后就用菌液当模板了
7楼2012-04-12 16:18:15
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