应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs 固定分子内部结构
31/1返回列表
查看: 950  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jessesunlu

新虫 (正式写手)

[交流] gromacs 固定分子内部结构 已有1人参与

gromacs用constraint 固定分子内部结构时候重复估计很多  常常出现lincs warning    有没有简单点的方法保持分子结构不变呢？  谢谢解答
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-03-13 20:46:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2012-03-14 08:03:31
设置冗余的 BOND 和 ANGLE 应该就行吧，
比方说三个原子 A B C  ，本来只有A与B成键  ，B与C成键

你人为的给AC之间加个键，键长就是AC之间的距离，并且键能给设定大一些，
然后设置 ABC之间的角度，这样应该结构就不会变化了。

相当于三角形最稳定的道理。
赞一下 回复此楼
2楼2012-03-13 23:26:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jessesunlu

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-03-13 23:26:14:
设置冗余的 BOND 和 ANGLE 应该就行吧，
比方说三个原子 A B C  ，本来只有A与B成键  ，B与C成键

你人为的给AC之间加个键，键长就是AC之间的距离，并且键能给设定大一些，
然后设置 ABC之间的角度，这样应该 ...

恩  有这么想过  但是这样做整个体系的能量就改变了阿
赞一下 回复此楼
3楼2012-03-23 20:01:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jessesunlu 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭