24小时热门版块排行榜    

查看: 1388  |  回复: 4

dndxwoaini

新虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】gromacs 并行 mpirun 已有4人参与

gmx4.05  我用下面这个命令也能跑起来,也显示2个cpu在工作,可是所化的时间和不并行是一样的,甚至还多点,为什么?
mpirun  C mdrun -s topol.tpr
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

命令行有错误吧?
2楼2011-03-16 20:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-25 13:19:53
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-05 19:50:36
引用回帖:
Originally posted by dndxwoaini at 2011-03-16 00:03:50:
gmx4.05  我用下面这个命令也能跑起来,也显示2个cpu在工作,可是所化的时间和不并行是一样的,甚至还多点,为什么?
mpirun  C mdrun -s topol.tpr

这个问题我也遇到过,请教了很多人还是没有解决,不知道是不是并行程序和你的CPU兼容性不好的原因,我是直接安装了GMX4.5.3之后好用的,我的CPU是I3,用的是CMAKE编译。
3楼2011-03-16 22:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dndxwoaini

新虫 (小有名气)

谢谢,问题已解决,重新安装了就好了
4楼2011-03-25 12:12:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

datian827

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个问题我也纠结了好几天了,看了这个帖子后,我果断决定,换个版本试试
5楼2011-04-04 21:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dndxwoaini 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +4 Zhao anqi 2026-03-22 4/200 2026-03-22 16:14 by lature00
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 广西大学材料导师推荐 +3 夏夏夏小正 2026-03-17 5/250 2026-03-21 22:20 by 金昊ML
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 初始318分求调剂(有工作经验) +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:22 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕英一数二306 +7 z1z2z3879 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:48 by JourneyLucky
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
请填处理意见