24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 1418  |  回复: 4

dndxwoaini

新虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】gromacs 并行 mpirun 已有4人参与

gmx4.05  我用下面这个命令也能跑起来,也显示2个cpu在工作,可是所化的时间和不并行是一样的,甚至还多点,为什么?
mpirun  C mdrun -s topol.tpr
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

命令行有错误吧?
2楼2011-03-16 20:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-25 13:19:53
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-05 19:50:36
引用回帖:
Originally posted by dndxwoaini at 2011-03-16 00:03:50:
gmx4.05  我用下面这个命令也能跑起来,也显示2个cpu在工作,可是所化的时间和不并行是一样的,甚至还多点,为什么?
mpirun  C mdrun -s topol.tpr

这个问题我也遇到过,请教了很多人还是没有解决,不知道是不是并行程序和你的CPU兼容性不好的原因,我是直接安装了GMX4.5.3之后好用的,我的CPU是I3,用的是CMAKE编译。
3楼2011-03-16 22:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dndxwoaini

新虫 (小有名气)

谢谢,问题已解决,重新安装了就好了
4楼2011-03-25 12:12:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

datian827

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个问题我也纠结了好几天了,看了这个帖子后,我果断决定,换个版本试试
5楼2011-04-04 21:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dndxwoaini 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 药学求调剂 +11 喽哈加油 2026-04-14 13/650 2026-04-14 21:14 by qingfeng258
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-11 13/650 2026-04-14 19:18 by Art1977
[考研] 291分调剂 +6 上岸小莹加油 2026-04-09 7/350 2026-04-14 17:58 by lhj2009
[考研] 367求调剂 +11 hffQAQ 2026-04-09 11/550 2026-04-14 17:48 by lhj2009
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +32 yzyzx 2026-04-12 36/1800 2026-04-14 17:45 by lhj2009
[考研] 恳请有学校收留 +3 柯淮然 2026-04-12 3/150 2026-04-14 16:25 by 逆水乘风
[考研] 366求调剂 +11 不知名的小卅 2026-04-11 11/550 2026-04-14 15:50 by zs92450
[考研] 材料复试求调剂 +24 xhhdjdjsjks 2026-04-09 24/1200 2026-04-13 15:49 by 幸免 ..
[考研] 314求调剂 +24 wakeluofu 2026-04-09 25/1250 2026-04-13 08:58 by lhj2009
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 求调剂,一志愿材料科学与工程985,365分, +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 277 数一104,学硕,求调剂 +21 瓶子PZ 2026-04-09 23/1150 2026-04-11 23:12 by labixiaoqiao
[考研] 070300化学279求调剂 +19 哈哈哈^_^ 2026-04-08 20/1000 2026-04-11 20:43 by stoner78
[考研] 284求调剂 +11 archer.. 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:23 by 蓝云思雨
[考研] 0854调剂 +5 音像店听花鼓戏 2026-04-10 5/250 2026-04-11 10:49 by qingpingzhu
[考研] 调剂 +4 电气300求调剂不 2026-04-08 7/350 2026-04-11 10:44 by 紫曦紫棋
[考研] 中科院总分315求调剂 +8 lallalh 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:30 by dick_runner
[考研] 一志愿中科大070300化学,314分求调剂 +12 wakeluofu 2026-04-09 12/600 2026-04-10 09:57 by liuhuiying09
[考研] 材料化工总分334求调剂 +16 Riot2025 2026-04-08 17/850 2026-04-09 20:19 by maddjdld
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂,接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
信息提示
请填处理意见