24小时热门版块排行榜    

查看: 1390  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dndxwoaini

新虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】gromacs 并行 mpirun 已有4人参与

gmx4.05  我用下面这个命令也能跑起来,也显示2个cpu在工作,可是所化的时间和不并行是一样的,甚至还多点,为什么?
mpirun  C mdrun -s topol.tpr
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-25 13:19:53
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-05 19:50:36
引用回帖:
Originally posted by dndxwoaini at 2011-03-16 00:03:50:
gmx4.05  我用下面这个命令也能跑起来,也显示2个cpu在工作,可是所化的时间和不并行是一样的,甚至还多点,为什么?
mpirun  C mdrun -s topol.tpr

这个问题我也遇到过,请教了很多人还是没有解决,不知道是不是并行程序和你的CPU兼容性不好的原因,我是直接安装了GMX4.5.3之后好用的,我的CPU是I3,用的是CMAKE编译。
3楼2011-03-16 22:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

命令行有错误吧?
2楼2011-03-16 20:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dndxwoaini

新虫 (小有名气)

谢谢,问题已解决,重新安装了就好了
4楼2011-03-25 12:12:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

datian827

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个问题我也纠结了好几天了,看了这个帖子后,我果断决定,换个版本试试
5楼2011-04-04 21:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +3 这么名字咋样 2026-03-22 4/200 2026-03-22 17:56 by 云民大李老师
[考研] 323求调剂 +5 洼小桶 2026-03-18 5/250 2026-03-22 17:38 by luoyongfeng
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-20 3/150 2026-03-22 16:00 by ColorlessPI
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 5/250 2026-03-20 22:11 by 云游重阳
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生(接收计算机专业调剂) +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
信息提示
请填处理意见