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PCR目的条带没跑出,但是跑出了特异性很强的单一条带,是什么原因呢?
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xiaoyang123
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]
PCR目的条带没跑出,但是跑出了特异性很强的单一条带,是什么原因呢?
PCR目的条带没跑出,但是跑出了特异性很强的单一条带,是什么原因呢?
其实不是很确定目的基因是否存在,如果存在,目的条带的期望长度是1300bp左右,但是跑出的单一条带却在900bp左右,而且用的是TAKARA HS Taq酶(高特异性Taq酶)……这会是什么原因造成的呢?
高特异性聚合酶是否只是防止突变,并不会减少假阳性呢?
但是跑出了单一带,怎么偏偏不是目的条带呢,太诡异了~~
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1楼
2011-11-20 22:04:03
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howbigpig
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专业: 植物遗传学
【答案】应助回帖
PCR产物直接测序 (生工20块,华大25块)然后得到的序列去blast 就可以弄清楚到底是不是目的条带了
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6楼
2011-11-23 16:53:54
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zlu520
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【答案】应助回帖
xiaoyang123(金币+1): 或许是扩增不完全,可是延伸时间为2min,应该已经比较长了吧,是否有其它原因导致了扩增不完全~~ 2011-11-24 14:35:33
引用回帖:
1楼
:
Originally posted by
xiaoyang123
at 2011-11-20 22:04:03:
PCR目的条带没跑出,但是跑出了特异性很强的单一条带,是什么原因呢?
其实不是很确定目的基因是否存在,如果存在,目的条带的期望长度是1300bp左右,但是跑出的单一条带却在900bp左右,而且用的是TAKARA HS T ...
有可能扩增不完全。。。。
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无完人!
2楼
2011-11-20 23:51:40
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allmessup
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【答案】应助回帖
xiaoyang123(金币+1): 又一种可能 2011-11-24 14:35:57
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
zlu520
at 2011-11-20 23:51:40:
有可能扩增不完全。。。。
re~如果存在相似度高的序列片段有可能被误以为是复制终点~
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Ipsascientiapotestasest.
3楼
2011-11-21 07:00:28
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moqiyilei
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【答案】应助回帖
xiaoyang123(金币+1): 引物在Genebank上比对匹配度都不高,是直接来自文献的,所以实验一开始就有点空中楼阁的感觉 2011-11-24 14:36:54
引物blast一下,看是否具有特异性。
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4楼
2011-11-21 09:09:51
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