应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
131/2返回列表12下一页
查看: 6216  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？

sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
珍惜有阳光、健康的时光！
1楼 2011-11-09 13:13:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

13581286695

铜虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 20:04:54
先选中配体高亮，点击Edit，merge，右边框选择蛋白，点击删除符号，这时会发现氢键不见了，然后点击export，设置格式有mol2变为PDB，大功告成
赞一下(1人) 回复此楼
天道酬勤
9楼2014-05-28 20:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

judy127

新虫 (小有名气)
同问
回复此楼
2楼2011-11-11 18:59:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)
自己顶下
回复此楼
珍惜有阳光、健康的时光！
3楼2011-11-14 12:27:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 菜兄又出现了~哈哈 2011-11-16 13:19:24
merge （合并）小分子和蛋白，然后保存pdb
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-11-16 10:51:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiaolin530

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-11-23 19:07:37
leirongjian(金币+5): 很好谢谢！ 2011-11-24 14:24:13
Build -merge 选中一个 点all ok；在随后出现的对话框里选另外一个，ok，就合并了 再删除原来复制过去的那个分子  然后保存为pdb文件即可。
赞一下(1人) 回复此楼
上联:沉默是金,下联:吃苦是福,横批:忍
5楼2011-11-23 15:27:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caidong0804

铁杆木虫 (正式写手)
Build -merge 选中一个 点all ok
sybyl中有吗？
赞一下 回复此楼
6楼2011-11-28 19:13:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiaolin530

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by caidong0804 at 2011-11-28 19:13:38:
Build -merge 选中一个 点all ok
sybyl中有吗？

点Build/edit  下拉菜单里有个merge的哈
赞一下 回复此楼
上联:沉默是金,下联:吃苦是福,横批:忍
7楼2011-11-30 14:47:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的鱼

木虫 (小有名气)
引用回帖:
1楼: Originally posted by leirongjian at 2011-11-09 13:13:07:
sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？

可以在对接界面中把配体和受体选中了，保存为mol2，然后用其他软件另存就可以了
赞一下 回复此楼
科研就是讨论出来的
8楼2011-12-01 17:05:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 13581286695 at 2014-05-28 20:07:38
先选中配体高亮，点击Edit，merge，右边框选择蛋白，点击删除符号，这时会发现氢键不见了，然后点击export，设置格式有mol2变为PDB，大功告成

谢谢啦
回复此楼
珍惜有阳光、健康的时光！
10楼2014-05-31 07:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 leirongjian 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭