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如何将有小分子配体的pdb文件转成Tinker的xyz文件呢？
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各位大侠好。。。 蛋白质的pdb文件有小分子，是用amber的小分子力场生成的。。在转化成tinker的xyz坐标的时候，总是会出错。。。想咨询下如何生成带有小分子配体的tinker的xyz文件呢？ 我试过babel了。。可是那些小配体它们不认哇。。 还有其他的方法了么？ 此外，tinker的原子类型和amber的貌似不太一样，那么有没有具体的tinker的原子类型讲解？ 多谢！ |
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 amber |
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