| 查看: 2148 | 回复: 5 | |||
[求助]
如何将有小分子配体的pdb文件转成Tinker的xyz文件呢？
|
|
各位大侠好。。。 蛋白质的pdb文件有小分子，是用amber的小分子力场生成的。。在转化成tinker的xyz坐标的时候，总是会出错。。。想咨询下如何生成带有小分子配体的tinker的xyz文件呢？ 我试过babel了。。可是那些小配体它们不认哇。。 还有其他的方法了么？ 此外，tinker的原子类型和amber的貌似不太一样，那么有没有具体的tinker的原子类型讲解？ 多谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 amber |
» 猜你喜欢
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有6人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有74人回复
-
岩土工程学报什么时候才能终审完呐
已经有4人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
-
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有26人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有16人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
已经有12人回复
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-03-28 17:29:36
3楼2013-04-02 10:51:22
4楼2013-04-02 10:53:15
fhh2626
木虫 (正式写手)
- 应助: 135 (高中生)
- 金币: 2354.1
- 红花: 7
- 帖子: 344
- 在线: 139小时
- 虫号: 1475956
- 注册: 2011-11-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2013-04-02 10:53:48
6楼2013-04-02 12:07:59
