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策马入林

新虫 (小有名气)

[求助] 求助蛋白质三维建模

老板今天给我一个任务，实验室现在有一个改造的双功能酶（两个酶通过一段肽链连接起来），想让我模拟出它的三维结构来进行分析，单个酶的同源模型可以找到，请问需要利用什么软件可以实现这个建模，具体怎样做呢，希望各位大侠指点一二
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生物信息学 结构生物学 蛋白结构及分子对接

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1楼 2013-09-22 20:49:39
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-23 08:52:27
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2楼2013-09-22 21:43:20
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-09-23 09:45:27
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3楼2013-09-22 21:47:05
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普通回帖

策马入林

新虫 (小有名气)
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4楼2013-09-22 22:13:00
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策马入林

新虫 (小有名气)
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5楼2013-09-22 22:13:59
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

陈正隆等，分子模拟的理论与实践，化学工业出版社，2007年第二版。
要想对分子模拟有一个初步的比较完善的理解需要看： 陈正隆等，分子模拟的理论与实践，化学工业出版社，2007年第二版，下载：
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/24963759.html

这本书可不是初级的，我以前好告诉别用MMB的413_Protein Structure Prediction 2nd ed，但是回答后所有提问者都说太复杂，不接受，更不看我说的原理，所以现在回答此类问题，我再不提原理和413_Protein Structure Prediction 2nd ed了。
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6楼2013-09-23 11:55:57
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

要深入一些做分子模拟，至少要熟悉微积分、线性代数和热力学与统计力学，这些我倒是学过。不过问我蛋白质空间预测的人都是要求立刻用软件和网络数据库进行操作，而不是关心具体原理。
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7楼2013-09-23 12:00:43
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

D.J.Rigden edits,From Protein Structure to Function with Bioinformatics(2009)
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6382178
这本书你也可以看看。
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8楼2013-09-23 12:04:04
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策马入林

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-09-23 12:00:43
要深入一些做分子模拟，至少要熟悉微积分、线性代数和热力学与统计力学，这些我倒是学过。不过问我蛋白质空间预测的人都是要求立刻用软件和网络数据库进行操作，而不是关心具体原理。

那个深入的研究估计现在一时半会是不成了，可以推荐些软件或门道吗
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9楼2013-09-23 12:35:58
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策马入林

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-09-23 12:04:04
D.J.Rigden edits,From Protein Structure to Function with Bioinformatics(2009)
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6382178
这本书你也可以看看。

多谢哈
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10楼2013-09-23 12:36:13
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