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zhoubin4111

木虫 (正式写手)

[求助] 蛋白质高级结构预测

导师让我预测蛋白质结构，但是我压根对着方面就不懂，听一位老师说同源模建这个方法比较准确，但是我比对了一下没有找到相似的蛋白结构，请问各位我应该用什么方法进行预测啊，还有就是我一个压根不懂这方面的预测出来的可能性有多大，我的课题一直很纠结，不想再浪费时间了，请各位高手指点一下
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1楼 2012-01-06 08:50:47
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ferlich

禁虫 (小有名气)
★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm(金币+1): 谢谢~ 2012-01-06 10:49:26
zhoubin4111(金币+1): 2012-01-08 10:01:59
本帖内容被屏蔽
2楼2012-01-06 10:43:51
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duotojh

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhoubin4111(金币+2): 2012-01-08 10:02:07
chaizhm(金币+3): 谢谢~ 2012-01-09 11:35:26
一般来说，蛋白质三级结构预测可以分为同源模建、序列穿线法（也叫折叠识别）和从头预测三类，
序列相似性较大时同源模建才可以给出相当精确的预测结构，这是一种比较成熟的方法；
当序列相似性极低时，则只能使用从头预测的方法，且预测精度低；
而序列相似性介于前两者之间时，可以使用穿线法进行折叠识别，得到的预测精度也是介于前两者之间。
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3楼2012-01-07 21:40:42
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anquren

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zhoubin4111(金币+1): ★有帮助 2012-01-09 09:24:44
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2012-01-11 19:43:27
找个人给你做，发文章时挂个名字就行。
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4楼2012-01-08 21:38:03
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zhoubin4111

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by anquren at 2012-01-08 21:38:03:
找个人给你做，发文章时挂个名字就行。

网上有的什么服务器要把一级序列传上去，是不是就是别人帮你做，他们也没说收费什么都没说，就让留个邮箱然后就等
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5楼2012-01-09 09:23:39
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870609

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhoubin4111(金币+1): 2012-01-09 10:47:23
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-01-11 19:44:14
swiss model 超级傻瓜，你可以先看一些计算化学以及蛋白质物理学，蛋白质结构预测的书，先看看理论再说，其次还要学一些分你动力学的知识
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6楼2012-01-09 09:28:42
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zhoubin4111

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by 870609 at 2012-01-09 09:28:42:
swiss model 超级傻瓜，你可以先看一些计算化学以及蛋白质物理学，蛋白质结构预测的书，先看看理论再说，其次还要学一些分你动力学的知识

swiss model 不是用同源模建那个方法时用的吗
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7楼2012-01-09 10:49:00
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870609

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by zhoubin4111 at 2012-01-09 10:49:00:
swiss model 不是用同源模建那个方法时用的吗

是啊，你不是就是要同源建模吗？
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8楼2012-01-11 10:05:13
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zhoubin4111

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by 870609 at 2012-01-11 10:05:13:
是啊，你不是就是要同源建模吗？

我没有找到相似性较高的结构，应该是没办法用同源模建
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9楼2012-01-12 08:50:00
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