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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
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零等级

木虫 (职业作家)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 13581286695 at 2014-05-28 20:07:38
先选中配体高亮，点击Edit，merge，右边框选择蛋白，点击删除符号，这时会发现氢键不见了，然后点击export，设置格式有mol2变为PDB，大功告成

也成功了，但还要请教下，这里是必须删除氢键？还是在选择配体时就默认的吧氢键选上了？
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11楼2014-07-17 11:15:32
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素君~~~

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by caixin5120 at 2011-11-16 10:51:53
merge （合并）小分子和蛋白，然后保存pdb

为什么sybyl中的merge一直不能选择呢？还有对接后，只有结果，没找到蛋白和配体的结构，怎么回事呢？
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在最值得奋斗的日子，好好学习，天天向上，这不也是一种幸福吧
12楼2015-06-10 15:41:31
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sunshine???

新虫 (职业作家)
Sybyl对接结果有好多个，如何把第二个merge进入？

发自小木虫Android客户端
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13楼2018-03-09 23:19:34
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