应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
51/1返回列表
查看: 6267  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？

sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
珍惜有阳光、健康的时光！
1楼 2011-11-09 13:13:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

13581286695

铜虫 (小有名气)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-05-30 20:04:54
先选中配体高亮，点击Edit，merge，右边框选择蛋白，点击删除符号，这时会发现氢键不见了，然后点击export，设置格式有mol2变为PDB，大功告成
赞一下(1人) 回复此楼
天道酬勤
9楼2014-05-28 20:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 菜兄又出现了~哈哈 2011-11-16 13:19:24
merge （合并）小分子和蛋白，然后保存pdb
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-11-16 10:51:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiaolin530

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-11-23 19:07:37
leirongjian(金币+5): 很好谢谢！ 2011-11-24 14:24:13
Build -merge 选中一个 点all ok；在随后出现的对话框里选另外一个，ok，就合并了 再删除原来复制过去的那个分子  然后保存为pdb文件即可。
赞一下(1人) 回复此楼
上联:沉默是金,下联:吃苦是福,横批:忍
5楼2011-11-23 15:27:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caidong0804

铁杆木虫 (正式写手)
Build -merge 选中一个 点all ok
sybyl中有吗？
赞一下 回复此楼
6楼2011-11-28 19:13:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 机械专硕325，寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 环境工程调剂 +6 大可digkids 2026-03-16 6/300 2026-03-16 17:16 by barlinike
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 331求调剂（0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分，求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[基金申请] 提交后的基金本子，已让学校撤回了，可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭