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yanjun3830

木虫 (正式写手)

[求助] 请教一下构建、表达方面的问题

为什么我构建的菌种只表达标签GST而不表达目的蛋白,想请教一下高手出现这种情况的原因会是什么呢?会不会是没连上,但是酶切鉴定还是好的啊!望这方面的高手给予指教,谢谢!
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【分子生物】EPI帖

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生活有时很无奈!
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足下客

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, EPI+1): 很专业了 2011-07-12 19:30:20
yanjun3830(金币+10): 谢谢,很不错的解答! 2011-07-13 08:58:43
1、你是否确定你构建的载体是完全正确地,只靠酶切验证时不够的,做PCR验证,再测序。
2、你连接上的这个基因片段用表达载体上的启动子可以启动表达吗?如果不可以,要克隆出这个基因自身的启动子,构建到表达载体上。
3、有些蛋白的表达可能需要很多因素,例如是否要加诱导剂、是否要低温表达等。

由于我只是以前看同学做过蛋白表达,这些原因也是同学碰到过的,所以只能给你提供这些建议了,仅供参考。

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2楼2011-07-12 12:44:53
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蓝月望宁

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-07-12 19:30:49
yanjun3830(金币+5): 谢谢! 2011-07-13 09:00:56
1.宿主菌合适吗?会不会,把你的外源基因表达产物降解,或者有抑制其表达的因素。
2。考虑下目的基因的表达量,检测方法的准确及精确性。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

坚持,一秒钟,就离,成功,近一步!
3楼2011-07-12 12:57:47
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yanjun3830

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 足下客 at 2011-07-12 12:44:53:
1、你是否确定你构建的载体是完全正确地,只靠酶切验证时不够的,做PCR验证,再测序。
2、你连接上的这个基因片段用表达载体上的启动子可以启动表达吗?如果不可以,要克隆出这个基因自身的启动子,构建到表达载 ...

上游引物是当初构建此蛋白的半分子的引物,半分子构建成功后表达量还是很不错的,现在只是把下游引物换成了全分子的引物,其他的都没变,可是构建了好几次都不表达目的蛋白,光表达GST。差不多花费了两个月了,烦人的很,学化学的人做生物真是伤不起啊!
生活有时很无奈!
4楼2011-07-13 08:56:40
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yanjun3830

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 蓝月望宁 at 2011-07-12 12:57:47:
1.宿主菌合适吗?会不会,把你的外源基因表达产物降解,或者有抑制其表达的因素。
2。考虑下目的基因的表达量,检测方法的准确及精确性。

这些因素好像不是问题所在,因为我构建的半分子表达量还是不错的!只是下游引物换成了全分子的!
生活有时很无奈!
5楼2011-07-13 09:01:46
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足下客

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


yanjun3830(金币+15): 谢谢回帖! 2011-07-14 09:14:04
引用回帖:
Originally posted by yanjun3830 at 2011-07-13 08:56:40:
上游引物是当初构建此蛋白的半分子的引物,半分子构建成功后表达量还是很不错的,现在只是把下游引物换成了全分子的引物,其他的都没变,可是构建了好几次都不表达目的蛋白,光表达GST。差不多花费了两个月了, ...

我不知道你说的半分子、全分子是什么意思。貌似是说现在构建的载体插入的基因片段比以前的大,对吧?不知道你插入的是多大的基因片段呢?
在这个全分子的基因扩增时有没有用高保真酶呢?因为大片段的基因在克隆时很容易发生突变,如果运气不好的话,突变在关键位点上,这个基因就不表达了呀。

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6楼2011-07-13 09:33:11
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yanjun3830

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 足下客 at 2011-07-13 09:33:11:
我不知道你说的半分子、全分子是什么意思。貌似是说现在构建的载体插入的基因片段比以前的大,对吧?不知道你插入的是多大的基因片段呢?
在这个全分子的基因扩增时有没有用高保真酶呢?因为大片段的基因在克 ...

全分子包含N-端和C-端两个半分子,共有500个bp,我是学化学的,进实验室后都是跟别人学着做这些东东,貌似基因扩增时用的酶是新买的,是TaKaRa的,好像不是高保真的!
生活有时很无奈!
7楼2011-07-14 09:13:39
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足下客

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, EPI+1): 一起奖励! 2011-07-14 10:47:35
引用回帖:
Originally posted by yanjun3830 at 2011-07-14 09:13:39:
全分子包含N-端和C-端两个半分子,共有500个bp,我是学化学的,进实验室后都是跟别人学着做这些东东,貌似基因扩增时用的酶是新买的,是TaKaRa的,好像不是高保真的!

500bp挺小的,不用高保真酶也可以。
我们构建重组质粒,连接上之后,做完PCR和酶切验证都要送去进行DNA测序的。所有的序列没有问题,才会进行后续的蛋白表达工作。
构建重组质粒有时候很简单,有时候又很麻烦,完全看你要表达的基因和用的载体。有时候基因还要克隆出自身的启动子和终止子,还有核糖体结合位点。
最好是问问懂的师兄师姐,以免浪费时间,走弯路。

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8楼2011-07-14 09:26:00
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ybs007

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5): 鼓励新虫交流 2011-07-14 17:08:25
1.不知道你具体是做原核表达还是做真核表达,选用那种质粒。就我目前做过的表达,有的质粒是整合到宿主基因组中表达的,有的是在细胞质中独立表达的。不管是哪一种,就您目前遇到的问题,可能是转化筛选阶段出现问题。
2.从质粒构建到表达这个过程中,我每次都是挑取阳性克隆做菌落PCR,然后把符合预期的测序,对照读码框是否无误,最后才进行表达。
3.菌落PCR:如果你连入的片段和两个酶切位点之间的片段大小差异很大,那么你可以选择载体两端引物来鉴定;如果片段差异不大,那么要做载体两端引物和目的片段上游和下游引物同时鉴定,当然也可以用载体的上游引物和目的片段的下游或者目的片段的上游和载体的下游引物来鉴定。
希望这点经验能对您有所帮助。
平生我自知
9楼2011-07-14 16:31:22
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匿名

用户注销 (小有名气)

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10楼2011-07-14 21:17:37
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