版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
申博辅导
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(3898)
>
文献求助
(459)
>
导师招生
(301)
>
虫友互识
(255)
>
论文投稿
(144)
>
硕博家园
(95)
>
博后之家
(94)
>
考博
(94)
>
基金申请
(89)
>
休闲灌水
(85)
>
招聘信息布告栏
(81)
>
绿色求助(高悬赏)
(58)
>
找工作
(36)
>
教师之家
(34)
>
论文道贺祈福
(32)
>
外文书籍求助
(32)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
分子模拟
»
Gromacs/Amber/NAMD
»
分子模拟时间越长越好吗?
2
1/1
返回列表
查看: 15750 | 回复: 44
查看全部回帖
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
本帖产生 9 个 模拟EPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖
奋斗1s
金虫
(正式写手)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 883.1
帖子: 416
在线: 107.9小时
虫号: 980571
[交流]
分子模拟时间越长越好吗?
如题,在对蛋白质做分子动力学模拟的时候,我用Gromacs先进行了3ns的MD运算,然后又进行了2ns,对接结果发现后者不如前者,但通过蛋白质评价发现后者的各项指标要好一些,请各位高手讨论一下MD多长时间比较好呢?
回复此楼
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
分子模拟
模型 - 模拟 - 统计 - 热力学
MDs-Gromacs
计算
gromacs
蛋白模拟与改造
分子模拟
精华帖转载
分子模拟
PBS作业排队系统
计算化学
分子动力学模拟
» 本帖已获得的红花(最新10朵)
ChemiAndy
» 猜你喜欢
论文终于录用啦!满足毕业条件了
已经有10人回复
2025年遐想
已经有4人回复
投稿Elsevier的杂志(返修),总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有8人回复
求个博导看看
已经有18人回复
» 本主题相关商家推荐:
(我也要在这里推广)
高级回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
对接的分子用于分子动力学模拟的问题
已经有12人回复
分子模拟中MSD的问题讨论
已经有25人回复
扩散系数的计算及体系平衡的判断
已经有4人回复
分子动力学的时间
已经有9人回复
gromacs结果分析怎样分析氢键能和结合能
已经有12人回复
LAMMPS中ReaxFF力场是怎么回事?
已经有17人回复
蛋白质构象模拟
已经有12人回复
关于材料的热力学稳定性 结构稳定性
已经有16人回复
金属功函数的测量方法有几种
已经有5人回复
什么动力学模拟软件可以模拟化学反应过程
已经有13人回复
如何评价误差和变化?
已经有10人回复
做离子液体的分子模拟,用哪个分子模拟的软件好呢?
已经有3人回复
gromacs 中g_msd问题
已经有8人回复
有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟
已经有14人回复
生测数据的标准差大于平均值,怎么办?
已经有7人回复
AMBER中qm/mm的问题
已经有5人回复
【讨论】分子模拟还是同源建模
已经有16人回复
【求助】msd算法
已经有10人回复
【求助】NAMD和Gromacs哪个简单?
已经有5人回复
【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题
已经有14人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
查看全部散金贴
武汉纺织大学电子与电气工程学院------院长团队招聘光电、材料类博士,博士后
+
1
/497
科瑞赛生物内皮细胞培养基试用装限时大放送,助力你的实验高效进阶!
+
1
/93
新年快乐!祝各位诸事顺遂!
+
1
/42
南科大薛亚辉课题组诚聘离子输运、低维器件、原子力显微镜等方向“快响行动”博士生
+
1
/38
中国科学院大连化学物理研究所DNL0902研究组招聘博士后和职工
+
1
/36
福建师范大学柔性电子学院招收2026年博士(储能材料与柔性电子器件)
+
2
/32
西北工业大学无人飞行器技术全国重点实验室拟招收电机/自动化方向博士1~2名
+
1
/31
衡水学院招收食品与营养方向联合培养研究生
+
1
/30
征女友 @长安
+
1
/24
南京工业大学招收2026年全日制学术博士(供热、供燃气通风与空调)
+
1
/14
吉林大学材料物理本科生求问调剂信息
+
1
/11
南京工业大学招收2026年全日制学术博士(供热、供燃气通风与空调)
+
1
/11
上海大学张进教授课题组诚招2026年秋季博士研究生
+
1
/8
青岛大学 丁欣 课题组 招收2026秋化学博士1名
+
1
/7
中国石油大学(北京)石油工程学院工程力学系诚聘博士后3-4名
+
1
/5
中国矿业大学黄赳课题组联合中国科学院南京土壤研究所朱晓芳研究员诚聘博士后
+
1
/3
西交利物浦大学——全奖博士名额(基因组学方向)
+
1
/2
211 院校 化学工程与技术 双一流学科 学术型博士研究生 尚有名额
+
1
/1
2026申请考核博士自荐-蛋白质组学/AI/药物设计/AIDD/化学生物学
+
1
/1
中科院上海有机所何智涛课题组招收2名博士后
+
1
/1
1楼
2011-06-30 16:00:04
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
xiaowu759
铁杆木虫
(著名写手)
应助: 49
(小学生)
金币: 15271.2
帖子: 1610
在线: 1526.4小时
虫号: 98977
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这是一个很好的讨论主题
赞
一下
回复此楼
40楼
2012-04-20 19:03:59
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
第一性原理
量子化学
计算模拟
分子模拟
仿真模拟
程序语言
我要订阅楼主
奋斗1s
的主题更新
2
1/1
返回列表
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
高级回复
(可上传附件)
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定