| 查看: 2703 | 回复: 4 | ||||
[求助]
扩散系数的计算及体系平衡的判断
|
| 我想模拟糖分子在水体系中与金表面的相互作用，采用Discover跑的动力学，扩散系数是许多分子的统计平均值的话，我所构建的模型中只含一个糖分子，想问下这个的模型计算扩散系数合适吗?如何判断体系有没有达到平衡态？我看到许多判断标准，有看动力学时间的，有看MSD对t曲线的，还有看lnMSD对lnt作图看是否成线性的，还有看RMSD是否平行于x轴呈一条直线，想问下如何得到RMSD随时间变化的曲线？我用的是MS 6.0，用的是Forcite模块分析，还有就是如果看是否呈线性的话r值是多少？比如我运行了5ns的动力学，3-4.5ns的呈线性这样是否达到平衡？问题比较多，希望高手指导 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 晶体模型计算分析 | 扩散系数 |
» 猜你喜欢
材料专硕(0856) 339分求调剂
已经有7人回复
-
081700学硕，323分，一志愿中国海洋大学求调剂学校
已经有15人回复
-
295求调剂
已经有10人回复
-
一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐
已经有10人回复
-
312求调剂
已经有3人回复
-
一志愿北京化工085600 310分求调剂
已经有12人回复
-
一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕
已经有8人回复
-
工科277分求调剂材料
已经有5人回复
-
电子信息调剂交叉学科有推荐吗
已经有9人回复
-
材料工程专硕求调剂
已经有11人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 通过计算判断下列氧化还原反应进行的方向及反应的平衡常数
已经有3人回复
- MSD(均方位移)有什么意义
已经有6人回复
- 交流阻抗低频扩散控制斜率意义
已经有21人回复
- 求助用MS模拟气体在分子筛中扩散系数时碰到的问题
已经有20人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 【求助】急！怎样判断unit中电荷平衡呢？
已经有19人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有105人回复
- 【有奖活动】回忆2010考研专业课题目
已经有54人回复
sciencejoy
新虫 (著名写手)
- 应助: 436 (硕士)
- 金币: 11207.1
- 红花: 90
- 帖子: 2974
- 在线: 498小时
- 虫号: 802149
- 注册: 2009-07-02
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2013-07-01 22:53:32
3楼2013-07-02 08:39:33
sciencejoy
新虫 (著名写手)
- 应助: 436 (硕士)
- 金币: 11207.1
- 红花: 90
- 帖子: 2974
- 在线: 498小时
- 虫号: 802149
- 注册: 2009-07-02
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
4楼2013-07-02 08:56:09
5楼2013-07-02 09:18:21
