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bear0329

金虫 (正式写手)

[求助] 16s rDNA 扩增引物的选择

各位大侠,小弟是刚接触PCR,我要扩增的是16srDNA,做T-RFLP,那么在引物的选择方面选什么好点呢?因为不同的引物扩增出的片段长度会有差异,这会不会影响后面的分析呢?谢谢
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以马内利!
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喔喔0208

新虫 (初入文坛)

肺炎链球菌不同型别的16S rRNA的引物怎么设计啊 求解~~~~
9楼2013-09-03 17:19:49
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查看全部 10 个回答

weidandande

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
bear0329(金币+1): 很好啊,谢谢~ 2011-06-07 13:10:31
dhd997(金币+3): good 2011-06-07 16:55:11
西瓜(金币+2, EPI+1): Good! 2011-07-05 17:17:02
个人认为,引物的选择得有以下几个方面。
1、能够较为稳定的扩增,产物单一、明亮;
2、各个引物若都符合上述要求,那么得测序得到序列后再进行分析;
3、习惯上序列长度越大,包含的信息量越多,但也不一定对自己的实验就好,总之还是得到该物种16SrDNA的长序列后,分析之,在确定使用那一对引物。16SrDNA有许多保守的引物,一开始做的话,尽量选择具有较长的PCR产物的引物
2楼2011-06-07 11:04:04
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树宝宝zyx

新虫 (小有名气)

你好啊,我也在做T-RFLP,你如何进行荧光检测,基因扫描啊,我们学校没有仪器基因测序仪,问了几家公司只提供测序,咋办呢。。。
科研真辛苦!
3楼2011-07-04 10:59:15
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 树宝宝zyx at 2011-07-04 10:59:15:
你好啊,我也在做T-RFLP,你如何进行荧光检测,基因扫描啊,我们学校没有仪器基因测序仪,问了几家公司只提供测序,咋办呢。。。

引物27F  1492R
4楼2011-07-04 14:17:45
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